25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0220 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0220  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0917921  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2122  hypothetical protein  61.16 
 
 
242 aa  320  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1747  hypothetical protein  61.16 
 
 
242 aa  316  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.672551  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2519  putative esterase  59.09 
 
 
242 aa  291  9e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.923946  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2439  hypothetical protein  56.61 
 
 
242 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2168  hypothetical protein  55.37 
 
 
242 aa  284  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0307  putative esterase  50.83 
 
 
241 aa  265  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.268113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2618  putative esterase  50 
 
 
239 aa  246  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1799  putative esterase  50.41 
 
 
239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.938464  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4003  putative esterase  50 
 
 
239 aa  236  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0053  putative esterase  47.93 
 
 
238 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177821  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0876  putative esterase  37.86 
 
 
245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.942655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4768  hypothetical protein  36.69 
 
 
243 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243089 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1340  putative esterase  35.8 
 
 
234 aa  151  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.524474 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0203  putative esterase  35.37 
 
 
249 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0438  putative esterase  31.82 
 
 
237 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3264  putative esterase  35.63 
 
 
248 aa  131  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678307  hitchhiker  0.000491614 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1643  hypothetical protein  35.29 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.64306  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5938  putative esterase  30.99 
 
 
235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0079  putative esterase  26.67 
 
 
360 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2354  tributyrin esterase EstA, putative  26.67 
 
 
255 aa  45.8  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1043  putative esterase  25 
 
 
274 aa  45.4  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  22.64 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  26.38 
 
 
640 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5713  putative esterase  25.79 
 
 
272 aa  42  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>