28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1747 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1747  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  500  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.672551  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2122  hypothetical protein  92.56 
 
 
242 aa  470  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0220  hypothetical protein  61.16 
 
 
242 aa  316  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0917921  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2519  putative esterase  60.34 
 
 
242 aa  300  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.923946  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2168  hypothetical protein  58.23 
 
 
242 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2439  hypothetical protein  57.02 
 
 
242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0307  putative esterase  53.72 
 
 
241 aa  274  9e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.268113 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1799  putative esterase  50.41 
 
 
239 aa  232  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.938464  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4003  putative esterase  46.28 
 
 
239 aa  228  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2618  putative esterase  48.35 
 
 
239 aa  225  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0053  putative esterase  49.59 
 
 
238 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177821  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4768  hypothetical protein  35.63 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243089 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1340  putative esterase  36.21 
 
 
234 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.524474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0438  putative esterase  33.74 
 
 
237 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0203  putative esterase  35.37 
 
 
249 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5938  putative esterase  34.3 
 
 
235 aa  145  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0876  putative esterase  32.4 
 
 
245 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.942655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3264  putative esterase  37.35 
 
 
248 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678307  hitchhiker  0.000491614 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1643  hypothetical protein  34.06 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.64306  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1578  putative esterase  31.21 
 
 
295 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1043  putative esterase  27.44 
 
 
274 aa  48.9  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1774  putative esterase  25.38 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000148005  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6266  putative esterase  23.31 
 
 
276 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  25.3 
 
 
295 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  26.06 
 
 
296 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5115  putative esterase  24.7 
 
 
295 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3253  putative esterase  24.7 
 
 
295 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  28.91 
 
 
642 aa  42.4  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>