34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1340 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1340  putative esterase  100 
 
 
234 aa  494  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.524474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0438  putative esterase  60.34 
 
 
237 aa  312  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5938  putative esterase  48.72 
 
 
235 aa  252  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4003  putative esterase  37.02 
 
 
239 aa  174  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1799  putative esterase  36.44 
 
 
239 aa  169  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.938464  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2618  putative esterase  34.32 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4768  hypothetical protein  33.88 
 
 
243 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243089 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1747  hypothetical protein  36.21 
 
 
242 aa  158  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.672551  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0307  putative esterase  31.4 
 
 
241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.268113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0220  hypothetical protein  35.8 
 
 
242 aa  151  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0917921  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2122  hypothetical protein  34.98 
 
 
242 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2168  hypothetical protein  33.88 
 
 
242 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0203  putative esterase  32.38 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0876  putative esterase  30.61 
 
 
245 aa  142  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.942655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2519  putative esterase  31.28 
 
 
242 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.923946  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2439  hypothetical protein  32.23 
 
 
242 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0053  putative esterase  32.63 
 
 
238 aa  138  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177821  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1643  hypothetical protein  34.15 
 
 
250 aa  132  6e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.64306  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3264  putative esterase  27.53 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678307  hitchhiker  0.000491614 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0423  putative esterase  25.95 
 
 
336 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1774  putative esterase  30.08 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000148005  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1987  putative esterase  25.58 
 
 
270 aa  48.9  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1883  putative esterase  23.57 
 
 
269 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0425  esterase, putative  25.33 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.2797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5713  putative esterase  24.32 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129647  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  22.67 
 
 
286 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03547  hypothetical protein  24.84 
 
 
398 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4275  glycoside hydrolase family 13 protein  24.84 
 
 
389 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4228  putative esterase  24.84 
 
 
364 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5450  putative esterase  32.84 
 
 
593 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03603  predicted xylanase  24.84 
 
 
398 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  44.74 
 
 
7149 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1666  putative esterase  23.48 
 
 
242 aa  42  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2341  putative esterase  21.52 
 
 
289 aa  42  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>