38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2618 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2618  putative esterase  100 
 
 
239 aa  498  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1799  putative esterase  91.63 
 
 
239 aa  460  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.938464  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4003  putative esterase  59 
 
 
239 aa  300  9e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0053  putative esterase  59.41 
 
 
238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177821  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0220  hypothetical protein  50 
 
 
242 aa  246  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0917921  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2519  putative esterase  46.69 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.923946  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2122  hypothetical protein  46.69 
 
 
242 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1747  hypothetical protein  48.35 
 
 
242 aa  225  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.672551  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2439  hypothetical protein  44.21 
 
 
242 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2168  hypothetical protein  44.63 
 
 
242 aa  204  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0307  putative esterase  40.91 
 
 
241 aa  201  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.268113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0876  putative esterase  37.71 
 
 
245 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.942655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5938  putative esterase  35.59 
 
 
235 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1340  putative esterase  34.32 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.524474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0438  putative esterase  34.96 
 
 
237 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0203  putative esterase  35.39 
 
 
249 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1643  hypothetical protein  36.86 
 
 
250 aa  150  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.64306  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4768  hypothetical protein  31.54 
 
 
243 aa  148  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3264  putative esterase  36.4 
 
 
248 aa  141  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678307  hitchhiker  0.000491614 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3530  putative esterase  28.07 
 
 
302 aa  48.5  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5051  putative esterase  28.24 
 
 
282 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  28.98 
 
 
296 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4526  putative esterase  28.24 
 
 
286 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  28.65 
 
 
295 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3253  putative esterase  28.07 
 
 
295 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2308  putative esterase  26.09 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5115  putative esterase  28.07 
 
 
295 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0800  putative esterase  25 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0423  putative esterase  24.19 
 
 
336 aa  45.4  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5713  putative esterase  25.99 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129647  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0458  putative esterase  31.13 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4242  putative esterase  23.03 
 
 
638 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.630883  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3320  esterase-like protein  25.56 
 
 
325 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494197  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1299  putative esterase  24.19 
 
 
322 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.528864  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2341  putative esterase  24.54 
 
 
289 aa  42.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416263  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1530  putative esterase  22.13 
 
 
295 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547916  normal  0.0514313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02190  predicted esterase  24.84 
 
 
279 aa  42.7  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0186  putative esterase  25.9 
 
 
265 aa  42.4  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>