22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4768 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4768  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243089 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0876  putative esterase  39.41 
 
 
245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.942655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0203  putative esterase  37.61 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2168  hypothetical protein  34.96 
 
 
242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2439  hypothetical protein  35.77 
 
 
242 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1643  hypothetical protein  36.32 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.64306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1747  hypothetical protein  35.63 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.672551  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2122  hypothetical protein  35.89 
 
 
242 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3264  putative esterase  32.77 
 
 
248 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678307  hitchhiker  0.000491614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1340  putative esterase  33.88 
 
 
234 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.524474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0220  hypothetical protein  36.69 
 
 
242 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0917921  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0307  putative esterase  35.08 
 
 
241 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.268113 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2519  putative esterase  34.41 
 
 
242 aa  155  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.923946  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0438  putative esterase  33.33 
 
 
237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1799  putative esterase  33.2 
 
 
239 aa  148  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.938464  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2618  putative esterase  31.54 
 
 
239 aa  148  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4003  putative esterase  31.4 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0053  putative esterase  34.58 
 
 
238 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177821  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5938  putative esterase  33.48 
 
 
235 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1299  putative esterase  23.18 
 
 
322 aa  46.2  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.528864  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4051  putative esterase  26.86 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314626  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0423  putative esterase  23.72 
 
 
336 aa  42.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>