74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0307 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0307  putative esterase  100 
 
 
241 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.268113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2122  hypothetical protein  56.2 
 
 
242 aa  285  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1747  hypothetical protein  53.72 
 
 
242 aa  274  9e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.672551  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0220  hypothetical protein  50.83 
 
 
242 aa  265  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0917921  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2519  putative esterase  47.93 
 
 
242 aa  246  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.923946  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2439  hypothetical protein  45.04 
 
 
242 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2168  hypothetical protein  44.21 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4003  putative esterase  41.32 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1799  putative esterase  42.56 
 
 
239 aa  204  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.938464  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2618  putative esterase  40.91 
 
 
239 aa  201  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0053  putative esterase  40.91 
 
 
238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177821  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4768  hypothetical protein  35.08 
 
 
243 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0438  putative esterase  34.3 
 
 
237 aa  154  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1340  putative esterase  31.4 
 
 
234 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.524474 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3264  putative esterase  37.96 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678307  hitchhiker  0.000491614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0876  putative esterase  32.1 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.942655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0203  putative esterase  32.93 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5938  putative esterase  31.4 
 
 
235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1643  hypothetical protein  31.38 
 
 
250 aa  128  6e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.64306  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1043  putative esterase  24.77 
 
 
274 aa  62  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5115  putative esterase  28.16 
 
 
295 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3253  putative esterase  28.16 
 
 
295 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  28.16 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  28.16 
 
 
296 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4810  putative esterase  24.62 
 
 
273 aa  55.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4526  putative esterase  26.14 
 
 
286 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5051  putative esterase  26.14 
 
 
282 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1578  putative esterase  27.39 
 
 
295 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5901  putative esterase  26.11 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3530  putative esterase  25.99 
 
 
302 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1260  putative esterase  26.54 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  27.61 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4242  putative esterase  25.62 
 
 
638 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.630883  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1883  putative esterase  25.71 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2109  putative esterase  26.11 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0655634  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0649  putative esterase  28.4 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0397008  normal  0.263924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1530  putative esterase  25.67 
 
 
295 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547916  normal  0.0514313 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  24.54 
 
 
640 aa  49.7  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2341  putative esterase  26.92 
 
 
289 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416263  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1987  putative esterase  21.88 
 
 
270 aa  49.3  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1774  putative esterase  25.43 
 
 
267 aa  48.9  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000148005  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1080  putative esterase  28.04 
 
 
522 aa  48.9  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.939989  normal  0.407507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2413  S-formylglutathione hydrolase  34.52 
 
 
290 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1341  putative esterase  28.41 
 
 
279 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1255  putative esterase  23.58 
 
 
301 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.469623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3665  putative esterase  25.9 
 
 
307 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0708  putative esterase  23.6 
 
 
285 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02190  predicted esterase  29.23 
 
 
279 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1101  putative esterase  41.38 
 
 
341 aa  45.8  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4097  putative esterase  26.11 
 
 
327 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4136  putative esterase  26.11 
 
 
327 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2890  ATPase  24.68 
 
 
274 aa  45.4  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.418152  hitchhiker  0.00752314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  25 
 
 
315 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1229  carboxylesterase  30.49 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.38 
 
 
657 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0957  putative esterase  24.22 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0079  putative esterase  24.2 
 
 
360 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  24.29 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.71 
 
 
649 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2354  tributyrin esterase EstA, putative  30.49 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0108  putative esterase  24.36 
 
 
369 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4144  putative esterase  23.33 
 
 
296 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1256  putative esterase  40.74 
 
 
375 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2308  putative esterase  25.48 
 
 
270 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  25.61 
 
 
319 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3256  S-formylglutathione hydrolase  34.15 
 
 
288 aa  42.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1407  putative esterase  23.93 
 
 
640 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00376031  normal  0.509577 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2653  putative esterase  28.05 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0051  periplasmic nitrate reductase, large subunit  30.86 
 
 
280 aa  42.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.649739 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2709  putative esterase  28.05 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2801  carboxylesterase  32.14 
 
 
294 aa  42.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.234504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2291  S-formylglutathione hydrolase  32.14 
 
 
294 aa  42  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2194  carboxylesterase  34.48 
 
 
289 aa  42  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1299  putative esterase  29.63 
 
 
322 aa  42  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.528864  normal  0.31083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>