29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5938 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5938  putative esterase  100 
 
 		 235 aa  492  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0438  putative esterase  53.19 
 
 		 237 aa  267  8.999999999999999e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1340  putative esterase  48.72 
 
 		 234 aa  252  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.524474 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1799  putative esterase  37.29 
 
 		 239 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.938464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2618  putative esterase  35.59 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4003  putative esterase  35.02 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0876  putative esterase  36.07 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.942655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0203  putative esterase  35.62 
 
 		 249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1747  hypothetical protein  34.3 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.672551  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0053  putative esterase  36.02 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177821  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2519  putative esterase  31.4 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.923946  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2122  hypothetical protein  33.06 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4768  hypothetical protein  33.48 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0307  putative esterase  31.4 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.268113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0220  hypothetical protein  30.99 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0917921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2168  hypothetical protein  29.51 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2439  hypothetical protein  29.51 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1643  hypothetical protein  32.07 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.64306  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3264  putative esterase  28.81 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678307  hitchhiker  0.000491614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0331  putative esterase  25.22 
 
 		 392 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3201  putative esterase  30.65 
 
 		 312 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0423  putative esterase  26.38 
 
 		 336 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  26.23 
 
 		 375 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1774  putative esterase  25.93 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000148005  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0184  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.13 
 
 		 698 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2527  alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 		 264 aa  42  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 264 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00570  conserved hypothetical protein  48.84 
 
 		 634 aa  42  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.351381  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  40.82 
 
 		 288 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>