More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20980 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_20980  Mg2+/Co2+ transporter  100 
 
 
348 aa  692    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.906501  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1832  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.57 
 
 
346 aa  176  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2248  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.8 
 
 
326 aa  170  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.373463  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0287  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.98 
 
 
436 aa  159  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523176  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4482  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.36 
 
 
374 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00436374  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4111  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.41 
 
 
417 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1482  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.41 
 
 
325 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0136304  normal  0.215972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0899  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.98 
 
 
368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0387  putative metal ion transporter  34.08 
 
 
372 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1999  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.11 
 
 
324 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.403451  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2213  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.7 
 
 
365 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0198  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.21 
 
 
357 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3978  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.47 
 
 
353 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3992  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.47 
 
 
353 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106328  normal  0.19247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4052  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.47 
 
 
353 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11264  magnesium and cobalt transport transmembrane protein corA  32.96 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00777117  hitchhiker  0.000740018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0204  Mg2 transporter protein CorA family protein  44.61 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174805  hitchhiker  0.00515093 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.85 
 
 
322 aa  135  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1876  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.69 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2163  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.25 
 
 
358 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0100402  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0171  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.58 
 
 
365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215108  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1428  magnesium/cobalt transporter CorA  34.43 
 
 
384 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0816  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.77 
 
 
367 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1248  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.98 
 
 
380 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.713487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4202  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.69 
 
 
327 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  0.0200868 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06540  Mg2+/Co2+ transporter  34.56 
 
 
363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1091  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.33 
 
 
322 aa  126  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4484  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.8 
 
 
382 aa  126  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00540479 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13880  Mg2+/Co2+ transporter  34.23 
 
 
330 aa  125  9e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00247267  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1207  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.15 
 
 
358 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3065  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  35.97 
 
 
318 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2624  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.07 
 
 
323 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0113  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.44 
 
 
378 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453825  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.08 
 
 
370 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4998  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.76 
 
 
381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442957  hitchhiker  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3987  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.22 
 
 
375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2565  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.18 
 
 
331 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6428  magnesium/cobalt transporter CorA  29.75 
 
 
380 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28210  Mg2+/Co2+ transporter  40.12 
 
 
371 aa  112  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3478  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.08 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119189 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4550  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.08 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2855  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.09 
 
 
331 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3755  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  31.44 
 
 
338 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2837  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.15 
 
 
338 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.23809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3838  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.23 
 
 
321 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01784  magnesium/cobalt transporter CorA  30.4 
 
 
323 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.53 
 
 
351 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1813  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.98 
 
 
367 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.406453  normal  0.0884578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0065  Mg2+ transporter protein, CorA-like  28.29 
 
 
323 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1621  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.31 
 
 
326 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2140  magnesium/cobalt transporter CorA  28.29 
 
 
323 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0674  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.55 
 
 
404 aa  103  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0642  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.17 
 
 
327 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.83 
 
 
325 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.95 
 
 
367 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.71 
 
 
354 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0036  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  28.46 
 
 
360 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.56 
 
 
324 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2098  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.71 
 
 
323 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.19 
 
 
325 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0098  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  27.91 
 
 
322 aa  100  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194887  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1081  magnesium/cobalt transporter CorA  34.69 
 
 
321 aa  99.4  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99494  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.77 
 
 
351 aa  99.4  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5733  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.35 
 
 
321 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.54 
 
 
383 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  26.19 
 
 
325 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.67 
 
 
325 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0881  putative metal ion transporter  30.23 
 
 
345 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00453  magnesium and cobalt transport protein  29.72 
 
 
333 aa  96.7  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1953  magnesium and cobalt transport protein  28.8 
 
 
337 aa  95.5  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  27.91 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.6 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2504  putative metal ion transport protein  34.69 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1888  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.8 
 
 
337 aa  94.4  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.63 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.43 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5404  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.46 
 
 
326 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0808766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.21 
 
 
354 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.88 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.56 
 
 
322 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.69 
 
 
355 aa  93.2  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.43 
 
 
357 aa  93.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7673  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.74 
 
 
334 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.690652  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1864  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.19 
 
 
321 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  34.48 
 
 
365 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2221  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.73 
 
 
321 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.24 
 
 
341 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.09 
 
 
353 aa  92  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0126  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.13 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000115284  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.05 
 
 
325 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.3 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.3 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.3 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1421  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.62 
 
 
323 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1347  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.92 
 
 
340 aa  90.1  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  28.9 
 
 
380 aa  90.1  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  25 
 
 
325 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2421  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.84 
 
 
322 aa  89.4  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.64 
 
 
379 aa  89.4  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2064  magnesium and cobalt transport protein, putative  43.27 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00816438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>