134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02360 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_02360  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  100 
 
 
177 aa  350  5.9999999999999994e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0086  GCN5-related protein N-acetyltransferase  57.89 
 
 
185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0623  Acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein-like protein  52.38 
 
 
163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5083  GCN5-related N-acetyltransferase  46.06 
 
 
195 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596364  normal  0.591106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4407  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 
230 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1733  GCN5-related N-acetyltransferase  40.59 
 
 
176 aa  97.4  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.321693  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2773  GCN5-related N-acetyltransferase  33.53 
 
 
188 aa  84.3  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5548  GCN5-related N-acetyltransferase  37.06 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.664924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0340  GCN5-related N-acetyltransferase  37.72 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0102  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3435  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.570602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4280  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.426403  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  36.45 
 
 
176 aa  58.9  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1840  GCN5-related N-acetyltransferase  45.19 
 
 
369 aa  58.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422252  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1972  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  34.65 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.710543  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6345  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.881821  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5893  Acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein-like protein  41.75 
 
 
352 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03180  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  36.69 
 
 
190 aa  55.1  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0972  GCN5-related N-acetyltransferase  42.16 
 
 
375 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.407544  normal  0.945637 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01384  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  30.69 
 
 
179 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2220  GCN5-related N-acetyltransferase  30.69 
 
 
179 aa  52  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213395  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1312  GCN5-related N-acetyltransferase  38.78 
 
 
189 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0167578  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2197  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
184 aa  52.4  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1606  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  30.69 
 
 
178 aa  52  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1747  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  30.69 
 
 
179 aa  52  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188764  hitchhiker  8.5342400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1652  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  30.69 
 
 
178 aa  52  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01395  hypothetical protein  30.69 
 
 
179 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7367  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
180 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958353  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1508  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  30.69 
 
 
178 aa  52  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2233  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  30.69 
 
 
178 aa  52  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0311  acetyltransferase related protein  25.71 
 
 
188 aa  51.2  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 
376 aa  51.2  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0565  acetyltransferase  26.39 
 
 
165 aa  51.2  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00392228  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0903  acetyltransferase  24.51 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.975526  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0766  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2278  GCN5-related N-acetyltransferase  37.72 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.172331  normal  0.20084 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5139  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.124755  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01310  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  35.78 
 
 
338 aa  49.3  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4217  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
186 aa  48.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0390  GCN5-related N-acetyltransferase  30.85 
 
 
181 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  30.85 
 
 
181 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5839  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
216 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1738  acetyltransferase  23.21 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1714  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.21 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000230477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.91 
 
 
180 aa  48.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1876  acetyltransferase  23.21 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3202  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
194 aa  48.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  29.91 
 
 
180 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1911  acetyltransferase, GNAT family  23.21 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.138005 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1955  acetyltransferase  23.21 
 
 
176 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.557592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  29.41 
 
 
180 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0402  GCN5-related N-acetyltransferase  30.48 
 
 
177 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1967  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
204 aa  47.8  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
182 aa  47.8  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  28.31 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1725  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  26.85 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1789  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  26.85 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00788192  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1550  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  26.85 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1731  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  26.85 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.415259  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  29.41 
 
 
180 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3474  acetyltransferase, GNAT family  25.15 
 
 
176 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1688  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.62 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.91 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3179  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3116  GCN5-related N-acetyltransferase  33.98 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3105  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5251  GCN5-related N-acetyltransferase  33.98 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  25.44 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5022  GCN5-related N-acetyltransferase  34.95 
 
 
178 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1868  acetyltransferase, GNAT family  25.15 
 
 
176 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1730  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170022  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0849  acetyltransferase  21.89 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 
205 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1728  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  26.85 
 
 
179 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.528186  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 
173 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2993  GCN5-related N-acetyltransferase  44.83 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.320971  normal  0.0159378 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3462  GCN5-related N-acetyltransferase  33.62 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2808  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  28.57 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2034  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
198 aa  45.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000135176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  29.06 
 
 
180 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  29.06 
 
 
180 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  29.06 
 
 
180 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8007  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 
187 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  30.1 
 
 
178 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  24.82 
 
 
188 aa  44.7  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3391  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6902  GCN5-related N-acetyltransferase  29.24 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.770732  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.684  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5564  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295471  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  36.11 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.204345  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2564  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
121 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451663  normal  0.927347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1855  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
377 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175358  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1733  GCN5-related N-acetyltransferase  22.02 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1984  acetyltransferase, GNAT family  24.56 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.819298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7751  Acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein-like protein  29.75 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464217  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01621  conserved hypothetical protein  30.63 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112063 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>