More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1626 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1626  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
941 aa  1929    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1619  serine/threonine protein kinase  92.24 
 
 
941 aa  1775    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.337467  normal  0.343807 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0961  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.31 
 
 
911 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001965  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 
450 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0732353  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4049  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.01 
 
 
971 aa  174  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00506  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
450 aa  170  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0118  putative protein kinase  35.05 
 
 
446 aa  170  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3644  protein kinase  31.96 
 
 
426 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0238226  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  42.79 
 
 
425 aa  137  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.88 
 
 
841 aa  137  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  34.96 
 
 
612 aa  137  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.5 
 
 
662 aa  134  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1389  serine/threonine protein kinase  34.47 
 
 
752 aa  134  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214576  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.04 
 
 
854 aa  133  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  35.5 
 
 
464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 
502 aa  132  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  41.58 
 
 
703 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  40.31 
 
 
612 aa  130  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.21 
 
 
653 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.2 
 
 
627 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  33.93 
 
 
825 aa  128  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  38.31 
 
 
621 aa  128  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.65 
 
 
757 aa  127  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2424  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31 
 
 
986 aa  127  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.918325  normal  0.204979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.97 
 
 
632 aa  127  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  33.5 
 
 
990 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.5 
 
 
518 aa  126  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4064  protein kinase  32.3 
 
 
863 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.731546  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.31 
 
 
598 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  36.32 
 
 
464 aa  125  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  37.8 
 
 
620 aa  125  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  31.34 
 
 
869 aa  125  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.18 
 
 
1036 aa  125  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  39.59 
 
 
614 aa  125  5e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  30.84 
 
 
662 aa  125  5e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.5 
 
 
668 aa  124  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  37.56 
 
 
625 aa  124  7e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 
651 aa  124  8e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  36.41 
 
 
907 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.69 
 
 
943 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2124  serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 
984 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  38.92 
 
 
565 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  37.06 
 
 
599 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1833  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.86 
 
 
982 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.465477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1751  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.2 
 
 
972 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  37.5 
 
 
457 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  37.06 
 
 
623 aa  121  4.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.68 
 
 
584 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1159  serine/threonine protein kinase  28.92 
 
 
767 aa  121  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0144344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.1 
 
 
627 aa  121  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.85 
 
 
551 aa  120  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  33.21 
 
 
625 aa  120  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  33.64 
 
 
666 aa  120  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  30.18 
 
 
597 aa  120  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  34.33 
 
 
664 aa  120  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  35.03 
 
 
571 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  34.33 
 
 
664 aa  120  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.37 
 
 
579 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  29.88 
 
 
982 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.12 
 
 
512 aa  120  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  32.21 
 
 
866 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  28.89 
 
 
667 aa  119  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  37.56 
 
 
656 aa  119  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.31 
 
 
1072 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.31 
 
 
1072 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  32.74 
 
 
784 aa  118  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.73 
 
 
715 aa  118  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 
985 aa  118  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.98 
 
 
553 aa  117  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.31 
 
 
1076 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 
690 aa  117  7.999999999999999e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  33.21 
 
 
692 aa  117  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1433  protein kinase  32.51 
 
 
963 aa  117  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698997  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.47 
 
 
681 aa  117  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32 
 
 
747 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  37.81 
 
 
382 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 
455 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 
1479 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.52 
 
 
652 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  36.63 
 
 
675 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0031  kinase domain protein  35.96 
 
 
320 aa  115  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 
666 aa  115  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  31.73 
 
 
651 aa  115  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  30.85 
 
 
666 aa  115  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.55 
 
 
657 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4569  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.52 
 
 
655 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.967984  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2983  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
982 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28698  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  34.31 
 
 
634 aa  115  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.55 
 
 
863 aa  115  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.09 
 
 
798 aa  115  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.76 
 
 
658 aa  115  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 
985 aa  115  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 
619 aa  114  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 
776 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.18 
 
 
528 aa  114  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  36.04 
 
 
657 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  36.04 
 
 
657 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  36.04 
 
 
657 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  33.5 
 
 
746 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  36.04 
 
 
657 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>