40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2437 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2437  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  266  8e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000639887  hitchhiker  0.000966367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1617  hypothetical protein  73.39 
 
 		 127 aa  192  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000562608  decreased coverage  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2772  hypothetical protein  70.63 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1586  hypothetical protein  70.63 
 
 		 128 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000390951  hitchhiker  0.0000000000775525 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2792  hypothetical protein  70.63 
 
 		 128 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000962258  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2867  hypothetical protein  70.63 
 
 		 128 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121266  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3038  hypothetical protein  67.2 
 
 		 128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000260642  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2471  hypothetical protein  69.84 
 
 		 128 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000395628  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1449  hypothetical protein  68 
 
 		 128 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  unclonable  0.0000000000491458 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1461  hypothetical protein  68 
 
 		 128 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000145947  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1396  hypothetical protein  66.4 
 
 		 128 aa  176  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000125062  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3100  hypothetical protein  64.29 
 
 		 148 aa  173  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2179  hypothetical protein  62.5 
 
 		 125 aa  169  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000382039  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3411  hypothetical protein  46.09 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111796  normal  0.118068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6298  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.8 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1060  hypothetical protein  42.28 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0670433  normal  0.188198 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1042  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.6 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.129945 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1459  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  41.94 
 
 		 128 aa  110  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2769  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.46 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03735  glyoxalase  38.21 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494145  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.37 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2166  lactoylglutathione lyase  36.8 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2822  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.77 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0875651  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0588  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6151  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.22 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606403  normal  0.343074 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.72 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4341  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.51 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.720982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0606  glyoxalase family protein  35.61 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.114771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3030  hypothetical protein  30.83 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0792  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.07 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.379546  normal  0.0722466 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2245  glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase family protein  30.33 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589372  hitchhiker  0.000106854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2749  hypothetical protein  36.43 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.495938 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.19 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0524594  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1138  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 		 247 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0861  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.63 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0917858  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1454  glutathione S-transferase, fosfomycin resistance protein, putative  25.4 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3931  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.594779  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0387  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.45 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0103253  normal  0.0182222 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3491  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.97 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>