61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6298 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6298  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
125 aa  257  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0588  hypothetical protein  49.6 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2437  hypothetical protein  41.8 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000639887  hitchhiker  0.000966367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3038  hypothetical protein  41.32 
 
 
128 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000260642  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03735  glyoxalase  42.15 
 
 
128 aa  113  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494145  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2772  hypothetical protein  42.62 
 
 
128 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2769  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.17 
 
 
125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2792  hypothetical protein  42.62 
 
 
128 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000962258  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1586  hypothetical protein  42.62 
 
 
128 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000390951  hitchhiker  0.0000000000775525 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2867  hypothetical protein  42.62 
 
 
128 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121266  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1617  hypothetical protein  40.5 
 
 
127 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000562608  decreased coverage  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1449  hypothetical protein  41.8 
 
 
128 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  unclonable  0.0000000000491458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4341  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.97 
 
 
141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402058  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1060  hypothetical protein  42.15 
 
 
123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0670433  normal  0.188198 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1459  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  41.13 
 
 
128 aa  110  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1461  hypothetical protein  41.8 
 
 
128 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000145947  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.8 
 
 
120 aa  107  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2471  hypothetical protein  41.8 
 
 
128 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000395628  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1396  hypothetical protein  40.98 
 
 
128 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000125062  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4457  hypothetical protein  48.78 
 
 
119 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.720982  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6151  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.34 
 
 
118 aa  105  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606403  normal  0.343074 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3100  hypothetical protein  40.16 
 
 
148 aa  105  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2179  hypothetical protein  44.35 
 
 
125 aa  104  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000382039  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1042  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.52 
 
 
140 aa  100  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129945 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2822  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.4 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0875651  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2166  lactoylglutathione lyase  36.67 
 
 
150 aa  99  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.16 
 
 
131 aa  97.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3411  hypothetical protein  41.13 
 
 
124 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111796  normal  0.118068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0606  glyoxalase family protein  46.46 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.114771  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0792  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.65 
 
 
128 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.379546  normal  0.0722466 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3030  hypothetical protein  34.75 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2245  glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase family protein  33.9 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589372  hitchhiker  0.000106854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2749  hypothetical protein  41.18 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.495938 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3903  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.15 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3246  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.87 
 
 
117 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0075  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2353  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.76 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000314642  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5495  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.86 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2973  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.6 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.196846  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2804  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.37 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0861  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.4 
 
 
254 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0917858  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2543  glyoxalase family protein  31.53 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2885  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 
141 aa  43.9  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.515742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3505  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.86 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.218896  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2807  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.23 
 
 
194 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64364  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2168  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.97 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3078  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.03 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3170  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.25 
 
 
250 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.25 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0490  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.83 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.653023 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3586  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.86 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 
329 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0815  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2664  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000389195  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4647  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.1 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0502496  normal  0.0279353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1285  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.07 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.78652  hitchhiker  0.00110448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4111  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.93 
 
 
122 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0482478  normal  0.0854177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5495  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.19 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00157513  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2453  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.37 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0624  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.86 
 
 
139 aa  40  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.0374079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>