35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1060 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1060  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  256  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0670433  normal  0.188198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03735  glyoxalase  51.64 
 
 
128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494145  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1459  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  49.19 
 
 
128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2166  lactoylglutathione lyase  43.8 
 
 
150 aa  123  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2769  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.8 
 
 
125 aa  120  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3038  hypothetical protein  43.09 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000260642  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2179  hypothetical protein  46.67 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000382039  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2437  hypothetical protein  42.28 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000639887  hitchhiker  0.000966367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6298  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.15 
 
 
125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2772  hypothetical protein  44.63 
 
 
128 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2867  hypothetical protein  44.63 
 
 
128 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121266  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2792  hypothetical protein  44.63 
 
 
128 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000962258  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1586  hypothetical protein  44.63 
 
 
128 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000390951  hitchhiker  0.0000000000775525 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3100  hypothetical protein  44.63 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1449  hypothetical protein  44.26 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  unclonable  0.0000000000491458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1396  hypothetical protein  44.26 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000125062  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1461  hypothetical protein  43.44 
 
 
128 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000145947  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1617  hypothetical protein  39.84 
 
 
127 aa  103  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000562608  decreased coverage  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2471  hypothetical protein  41.8 
 
 
128 aa  102  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000395628  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1042  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.21 
 
 
140 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129945 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2822  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.84 
 
 
136 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0875651  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3411  hypothetical protein  43.8 
 
 
124 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111796  normal  0.118068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0588  hypothetical protein  43.9 
 
 
127 aa  101  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4341  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.33 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402058  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6151  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606403  normal  0.343074 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.21 
 
 
131 aa  90.5  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.59 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4457  hypothetical protein  37.3 
 
 
119 aa  87  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.720982  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0792  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.59 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.379546  normal  0.0722466 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0606  glyoxalase family protein  37.98 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.114771  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2749  hypothetical protein  35.04 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.495938 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3030  hypothetical protein  30.51 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2245  glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase family protein  29.66 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589372  hitchhiker  0.000106854 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0629  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.86 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0643  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.78 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.58985e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>