44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6151 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6151  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
118 aa  239  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606403  normal  0.343074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4341  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.5 
 
 
141 aa  181  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402058  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0588  hypothetical protein  62.71 
 
 
127 aa  141  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4457  hypothetical protein  47.86 
 
 
119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.720982  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.26 
 
 
120 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03735  glyoxalase  40.83 
 
 
128 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494145  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0792  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.93 
 
 
128 aa  107  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.379546  normal  0.0722466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6298  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.34 
 
 
125 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1042  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.4 
 
 
140 aa  99  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129945 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0606  glyoxalase family protein  46.34 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.114771  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1396  hypothetical protein  37.1 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000125062  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2179  hypothetical protein  41.46 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000382039  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1060  hypothetical protein  40 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0670433  normal  0.188198 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1461  hypothetical protein  36.29 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000145947  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1449  hypothetical protein  36.29 
 
 
128 aa  91.7  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  unclonable  0.0000000000491458 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2471  hypothetical protein  38.71 
 
 
128 aa  91.3  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000395628  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2772  hypothetical protein  37.1 
 
 
128 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1586  hypothetical protein  37.1 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000390951  hitchhiker  0.0000000000775525 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3100  hypothetical protein  35.48 
 
 
148 aa  89.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2867  hypothetical protein  37.1 
 
 
128 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121266  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2749  hypothetical protein  46.09 
 
 
129 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.495938 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2792  hypothetical protein  37.1 
 
 
128 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000962258  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2769  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.29 
 
 
125 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1617  hypothetical protein  38.71 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000562608  decreased coverage  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1459  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  37.9 
 
 
128 aa  87.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3411  hypothetical protein  40.83 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111796  normal  0.118068 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2437  hypothetical protein  36.22 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000639887  hitchhiker  0.000966367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3038  hypothetical protein  36.29 
 
 
128 aa  84.3  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000260642  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2166  lactoylglutathione lyase  34.15 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2245  glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase family protein  33.61 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589372  hitchhiker  0.000106854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2822  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.15 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0875651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3030  hypothetical protein  31.93 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3213  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.68 
 
 
136 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1138  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.05 
 
 
247 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3438  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29360  glyoxalase, Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  32.82 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1554  glyoxalase family protein  30.61 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2714  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397884  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12650  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  29.91 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.228557  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0578  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.1 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.704686  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3931  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.84 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.594779  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2073  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38 
 
 
285 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2664  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
132 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000389195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>