37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2179 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2179  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  258  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000382039  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2792  hypothetical protein  65.04 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000962258  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2867  hypothetical protein  65.04 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121266  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2437  hypothetical protein  62.5 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000639887  hitchhiker  0.000966367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2772  hypothetical protein  65.04 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1586  hypothetical protein  65.04 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000390951  hitchhiker  0.0000000000775525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1617  hypothetical protein  65.08 
 
 		 127 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000562608  decreased coverage  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1461  hypothetical protein  62.3 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000145947  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1449  hypothetical protein  62.3 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  unclonable  0.0000000000491458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1396  hypothetical protein  62.3 
 
 		 128 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000125062  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3038  hypothetical protein  60.63 
 
 		 128 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000260642  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2471  hypothetical protein  61.48 
 
 		 128 aa  157  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000395628  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3100  hypothetical protein  58.87 
 
 		 148 aa  157  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3411  hypothetical protein  54.92 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111796  normal  0.118068 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1042  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.16 
 
 		 140 aa  123  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.129945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.39 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1060  hypothetical protein  46.67 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0670433  normal  0.188198 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1459  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  47.58 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6298  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.35 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03735  glyoxalase  41.67 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2822  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.34 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0875651  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0588  hypothetical protein  45.83 
 
 		 127 aa  103  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2769  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.2 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6151  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.46 
 
 		 118 aa  93.2  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606403  normal  0.343074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4341  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.32 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4457  hypothetical protein  37.19 
 
 		 119 aa  87.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.720982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.34 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2166  lactoylglutathione lyase  34.15 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0606  glyoxalase family protein  38.64 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.114771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3030  hypothetical protein  28.21 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2245  glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase family protein  28.21 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589372  hitchhiker  0.000106854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0792  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.25 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.379546  normal  0.0722466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2749  hypothetical protein  42.64 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.495938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2804  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.08 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7086  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29 
 
 		 129 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678926 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5734  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.75 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3170  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 		 250 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>