44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4341 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4341  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
141 aa  289  8e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402058  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6151  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.5 
 
 
118 aa  181  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606403  normal  0.343074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0588  hypothetical protein  63.56 
 
 
127 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4457  hypothetical protein  51.28 
 
 
119 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.720982  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6298  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.97 
 
 
125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.33 
 
 
120 aa  110  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1042  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.94 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1060  hypothetical protein  43.33 
 
 
123 aa  97.1  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0670433  normal  0.188198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03735  glyoxalase  38.66 
 
 
128 aa  96.7  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494145  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.27 
 
 
131 aa  96.7  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0606  glyoxalase family protein  43.9 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.114771  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0792  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.8 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.379546  normal  0.0722466 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2179  hypothetical protein  41.32 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000382039  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1461  hypothetical protein  38.21 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000145947  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1449  hypothetical protein  38.21 
 
 
128 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  unclonable  0.0000000000491458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1617  hypothetical protein  38.4 
 
 
127 aa  90.1  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000562608  decreased coverage  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2772  hypothetical protein  38.21 
 
 
128 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1396  hypothetical protein  37.4 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000125062  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2867  hypothetical protein  38.21 
 
 
128 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121266  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2792  hypothetical protein  38.21 
 
 
128 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000962258  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1586  hypothetical protein  38.21 
 
 
128 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000390951  hitchhiker  0.0000000000775525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3411  hypothetical protein  39.17 
 
 
124 aa  87  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111796  normal  0.118068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2769  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.4 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3038  hypothetical protein  37.6 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000260642  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3100  hypothetical protein  35.77 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2437  hypothetical protein  36.51 
 
 
128 aa  84.3  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000639887  hitchhiker  0.000966367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2471  hypothetical protein  36.59 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000395628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2749  hypothetical protein  43.41 
 
 
129 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.495938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2166  lactoylglutathione lyase  34.4 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1459  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  37.01 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2245  glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase family protein  33.91 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589372  hitchhiker  0.000106854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2822  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0875651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3030  hypothetical protein  29.82 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1138  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.91 
 
 
247 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12650  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  30.28 
 
 
128 aa  43.5  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.228557  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1694  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.24 
 
 
303 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2073  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.25 
 
 
285 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4066  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.46 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.32661 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2033  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0980  hypothetical protein  29.41 
 
 
228 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18940  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  33.93 
 
 
133 aa  41.2  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.700145  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4587  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.82 
 
 
261 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2418  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.188421  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2008  hypothetical protein  31.36 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0200718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>