40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0588 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0588  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  259  8.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4341  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.56 
 
 
141 aa  143  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402058  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6151  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.71 
 
 
118 aa  141  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606403  normal  0.343074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6298  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.6 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0792  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.83 
 
 
128 aa  115  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.379546  normal  0.0722466 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4457  hypothetical protein  50.42 
 
 
119 aa  110  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.720982  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.26 
 
 
120 aa  110  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2179  hypothetical protein  45.83 
 
 
125 aa  103  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000382039  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1060  hypothetical protein  43.9 
 
 
123 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0670433  normal  0.188198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2772  hypothetical protein  41.8 
 
 
128 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0606  glyoxalase family protein  50.41 
 
 
130 aa  98.2  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.114771  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03735  glyoxalase  39.84 
 
 
128 aa  97.8  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494145  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1461  hypothetical protein  40.16 
 
 
128 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000145947  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1449  hypothetical protein  39.39 
 
 
128 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  unclonable  0.0000000000491458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2867  hypothetical protein  41.8 
 
 
128 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121266  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1586  hypothetical protein  41.8 
 
 
128 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000390951  hitchhiker  0.0000000000775525 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2792  hypothetical protein  41.8 
 
 
128 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000962258  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1617  hypothetical protein  40.32 
 
 
127 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000562608  decreased coverage  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2437  hypothetical protein  40 
 
 
128 aa  94.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000639887  hitchhiker  0.000966367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1042  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.01 
 
 
140 aa  94.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129945 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1396  hypothetical protein  39.34 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000125062  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2471  hypothetical protein  40.16 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000395628  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3038  hypothetical protein  37.9 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000260642  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3100  hypothetical protein  37.7 
 
 
148 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1459  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  38.58 
 
 
128 aa  91.7  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.2 
 
 
131 aa  90.9  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2749  hypothetical protein  47.37 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.495938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2166  lactoylglutathione lyase  37.1 
 
 
150 aa  87.8  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3411  hypothetical protein  39.52 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111796  normal  0.118068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2769  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.77 
 
 
125 aa  83.6  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2822  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.15 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0875651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2245  glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase family protein  35.09 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589372  hitchhiker  0.000106854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3030  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4237  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.51 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4299  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.51 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.171024 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0643  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.87 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.58985e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0119  glyoxalase family protein  28.43 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0629  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.84 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3328  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.72 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0733  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.83 
 
 
117 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>