26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3738 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3681  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3864  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3738  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0587  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0660  hypothetical protein  90.56 
 
 
233 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0631  hypothetical protein  87.55 
 
 
233 aa  427  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000129796  normal  0.0702813 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0631  hypothetical protein  86.7 
 
 
233 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000012648  normal  0.149121 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3398  hypothetical protein  86.7 
 
 
233 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000101097  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4011  hypothetical protein  86.7 
 
 
233 aa  420  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3887  hypothetical protein  69.53 
 
 
233 aa  353  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0229924  normal  0.0459131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3786  hypothetical protein  69.53 
 
 
233 aa  352  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100132  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0714  hypothetical protein  69.53 
 
 
234 aa  348  5e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000507099  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3163  hypothetical protein  67.39 
 
 
252 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3197  hypothetical protein  66.09 
 
 
232 aa  323  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3119  hypothetical protein  65.67 
 
 
237 aa  323  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000244362  unclonable  0.0000043186 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0591  hypothetical protein  63.48 
 
 
233 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000830224  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2539  hypothetical protein  55.36 
 
 
237 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419304  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4402  hypothetical protein  48.07 
 
 
235 aa  231  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2117  hypothetical protein  49.3 
 
 
236 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1766  hypothetical protein  45.49 
 
 
235 aa  211  5.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621321  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1490  hypothetical protein  42.31 
 
 
234 aa  209  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0905179  normal  0.120908 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003724  hypothetical protein  43.48 
 
 
241 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000435899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1335  hypothetical protein  50.23 
 
 
248 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02065  hypothetical protein  43.04 
 
 
241 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0821  hypothetical protein  47 
 
 
241 aa  206  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000458892  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0840  hypothetical protein  44.73 
 
 
251 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.220158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>