26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3163 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3163  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  523  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3197  hypothetical protein  73.16 
 
 		 232 aa  368  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0631  hypothetical protein  69.53 
 
 		 233 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000012648  normal  0.149121 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3398  hypothetical protein  69.53 
 
 		 233 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4011  hypothetical protein  69.96 
 
 		 233 aa  341  7e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0631  hypothetical protein  69.53 
 
 		 233 aa  341  8e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000129796  normal  0.0702813 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0660  hypothetical protein  68.83 
 
 		 233 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0714  hypothetical protein  66.52 
 
 		 234 aa  330  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000507099  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0587  hypothetical protein  67.39 
 
 		 233 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3738  hypothetical protein  67.39 
 
 		 233 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3864  hypothetical protein  67.39 
 
 		 233 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3681  hypothetical protein  67.39 
 
 		 233 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3887  hypothetical protein  63.52 
 
 		 233 aa  317  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0229924  normal  0.0459131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3786  hypothetical protein  63.09 
 
 		 233 aa  315  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100132  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0591  hypothetical protein  63.04 
 
 		 233 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000830224  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3119  hypothetical protein  64.5 
 
 		 237 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000244362  unclonable  0.0000043186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2539  hypothetical protein  51.07 
 
 		 237 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419304  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4402  hypothetical protein  49.13 
 
 		 235 aa  231  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003724  hypothetical protein  45.06 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000435899  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0821  hypothetical protein  46.35 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000458892  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2117  hypothetical protein  48.26 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02065  hypothetical protein  44.78 
 
 		 241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1766  hypothetical protein  45.73 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621321  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1335  hypothetical protein  48.9 
 
 		 248 aa  218  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0840  hypothetical protein  43.57 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.220158 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1490  hypothetical protein  41.03 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0905179  normal  0.120908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>