27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3119 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3119  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  487  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000244362  unclonable  0.0000043186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3786  hypothetical protein  70.39 
 
 
233 aa  345  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100132  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0714  hypothetical protein  70.39 
 
 
234 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000507099  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3887  hypothetical protein  69.1 
 
 
233 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0229924  normal  0.0459131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0631  hypothetical protein  69.1 
 
 
233 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000129796  normal  0.0702813 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0660  hypothetical protein  69.1 
 
 
233 aa  332  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4011  hypothetical protein  68.67 
 
 
233 aa  329  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3398  hypothetical protein  67.81 
 
 
233 aa  329  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000101097  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0631  hypothetical protein  67.81 
 
 
233 aa  329  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000012648  normal  0.149121 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0587  hypothetical protein  65.67 
 
 
233 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3681  hypothetical protein  65.67 
 
 
233 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3738  hypothetical protein  65.67 
 
 
233 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3864  hypothetical protein  65.67 
 
 
233 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0591  hypothetical protein  66.96 
 
 
233 aa  318  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000830224  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3163  hypothetical protein  64.5 
 
 
252 aa  309  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3197  hypothetical protein  62.93 
 
 
232 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2539  hypothetical protein  53.85 
 
 
237 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419304  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4402  hypothetical protein  48.29 
 
 
235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0840  hypothetical protein  47.66 
 
 
251 aa  218  6e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.220158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2117  hypothetical protein  47.79 
 
 
236 aa  216  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003724  hypothetical protein  45.06 
 
 
241 aa  215  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000435899  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02065  hypothetical protein  45.22 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1490  hypothetical protein  41.03 
 
 
234 aa  210  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0905179  normal  0.120908 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0821  hypothetical protein  46.35 
 
 
241 aa  209  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000458892  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1335  hypothetical protein  45.27 
 
 
248 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1766  hypothetical protein  42.13 
 
 
235 aa  198  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0799  hypothetical protein  32.14 
 
 
479 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0295702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>