25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26490 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_26490  Helix-turn-helix protein  100 
 
 		 71 aa  143  8.000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08300  Helix-turn-helix protein  54.69 
 
 		 69 aa  72  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0532 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1176  putative transcriptional regulator, Nlp  52.24 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.035714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2002  putative transcriptional regulator, Nlp  50.75 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3664  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 66 aa  44.3  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000706861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  48.94 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  51.11 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  34.69 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  34.69 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  34.69 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  34.69 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  34.69 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45.45 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  34.69 
 
 		 69 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  34.69 
 
 		 69 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 420 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  34.69 
 
 		 69 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>