27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01740 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_01740  sortase, SrtB family  100 
 
 
369 aa  761    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.486978  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0723  sortase, SrtB family  37.25 
 
 
357 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000699088  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04190  sortase, SrtB family  36.47 
 
 
282 aa  171  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.736666  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4371  peptidase C60B sortase B  29.34 
 
 
254 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0032  sortase, SrtB family  25.29 
 
 
307 aa  106  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4277  surface protein cell wall anchor  28.96 
 
 
254 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4288  surface protein cell wall anchor  29.34 
 
 
254 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0080748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4657  sortase B  28.96 
 
 
254 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4438  hypothetical protein  28.96 
 
 
254 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0705255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4783  hypothetical protein  28.96 
 
 
254 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4652  sortase B  28.96 
 
 
254 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4667  hypothetical protein  28.51 
 
 
254 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0585  sortase B  32.6 
 
 
218 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4670  sortase B  31.28 
 
 
218 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12740  hypothetical protein  31.35 
 
 
275 aa  90.9  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1677  peptidase C60 sortase A and B  36.36 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0763151  normal  0.0326953 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0479  sortase family protein  26.01 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1386  sortase, SrtB family  29.26 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.439604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1216  peptidase C60B sortase B  28.4 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1194  peptidase C60B, sortase B  28.4 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0492  sortase B  27.07 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1511  peptidase C60 sortase A and B  29.02 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.504382  normal  0.828947 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00440  sortase, SrtB family  40.7 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0908  hypothetical protein  24.51 
 
 
244 aa  63.2  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0567  hypothetical protein  24.9 
 
 
365 aa  63.2  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0576914  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0797  peptidase C60 sortase A and B  29.56 
 
 
230 aa  53.1  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08150  hypothetical protein  28.87 
 
 
221 aa  50.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.447744  hitchhiker  0.0000000316905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>