26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1386 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1386  sortase, SrtB family  100 
 
 
258 aa  528  1e-149  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.439604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4371  peptidase C60B sortase B  33.07 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4667  hypothetical protein  33.07 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4277  surface protein cell wall anchor  33.07 
 
 
254 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4657  sortase B  33.07 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4438  hypothetical protein  33.07 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0705255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4783  hypothetical protein  33.07 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4652  sortase B  33.46 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4670  sortase B  34.2 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4288  surface protein cell wall anchor  37.16 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0080748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0585  sortase B  38.07 
 
 
218 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1216  peptidase C60B sortase B  31.1 
 
 
244 aa  99.4  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1194  peptidase C60B, sortase B  31.1 
 
 
244 aa  99.4  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0723  sortase, SrtB family  28.28 
 
 
357 aa  99  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000699088  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04190  sortase, SrtB family  29.08 
 
 
282 aa  95.9  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.736666  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0479  sortase family protein  33.86 
 
 
249 aa  92.8  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0492  sortase B  33.33 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00440  sortase, SrtB family  33.33 
 
 
307 aa  85.5  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0032  sortase, SrtB family  27.49 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01740  sortase, SrtB family  26.56 
 
 
369 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.486978  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0567  hypothetical protein  25.54 
 
 
365 aa  82  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0576914  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12740  hypothetical protein  28.27 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1677  peptidase C60 sortase A and B  29.48 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0763151  normal  0.0326953 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08150  hypothetical protein  26.77 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.447744  hitchhiker  0.0000000316905 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1511  peptidase C60 sortase A and B  25.93 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.504382  normal  0.828947 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0797  peptidase C60 sortase A and B  23.6 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>