26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00440 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00440  sortase, SrtB family  100 
 
 
307 aa  632  1e-180  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0492  sortase B  31.98 
 
 
249 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0479  sortase family protein  31.28 
 
 
249 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0585  sortase B  33.33 
 
 
218 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4667  hypothetical protein  32.77 
 
 
254 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4652  sortase B  32.2 
 
 
254 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4670  sortase B  32.77 
 
 
218 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4438  hypothetical protein  35.5 
 
 
254 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0705255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4657  sortase B  35.71 
 
 
254 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4783  hypothetical protein  35.5 
 
 
254 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4371  peptidase C60B sortase B  35.12 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4277  surface protein cell wall anchor  35.12 
 
 
254 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1216  peptidase C60B sortase B  29.23 
 
 
244 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1194  peptidase C60B, sortase B  29.23 
 
 
244 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4288  surface protein cell wall anchor  33.53 
 
 
254 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0080748  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04190  sortase, SrtB family  27.84 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.736666  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0032  sortase, SrtB family  46.05 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1386  sortase, SrtB family  36.08 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.439604  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0723  sortase, SrtB family  38.24 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000699088  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1677  peptidase C60 sortase A and B  30.41 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0763151  normal  0.0326953 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12740  hypothetical protein  28.5 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01740  sortase, SrtB family  40.7 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.486978  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0567  hypothetical protein  26.5 
 
 
365 aa  62.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0576914  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08150  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.447744  hitchhiker  0.0000000316905 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1511  peptidase C60 sortase A and B  32.32 
 
 
246 aa  56.2  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.504382  normal  0.828947 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0908  hypothetical protein  27.73 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>