26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0032 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0032  sortase, SrtB family  100 
 
 		 307 aa  645    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0723  sortase, SrtB family  33.85 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000699088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04190  sortase, SrtB family  29.6 
 
 		 282 aa  122  8e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.736666  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4277  surface protein cell wall anchor  30.83 
 
 		 254 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4371  peptidase C60B sortase B  30.83 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4657  sortase B  30.96 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4438  hypothetical protein  31.56 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0705255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4288  surface protein cell wall anchor  29.71 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0080748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4783  hypothetical protein  31.56 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4667  hypothetical protein  31.38 
 
 		 254 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4652  sortase B  30.96 
 
 		 254 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01740  sortase, SrtB family  29.19 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.486978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4670  sortase B  32.84 
 
 		 218 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0908  hypothetical protein  26.14 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0585  sortase B  32.35 
 
 		 218 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0492  sortase B  30.94 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0479  sortase family protein  29.9 
 
 		 249 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1216  peptidase C60B sortase B  29.39 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1194  peptidase C60B, sortase B  29.39 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00440  sortase, SrtB family  46.05 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1386  sortase, SrtB family  32.35 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.439604  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1511  peptidase C60 sortase A and B  26.72 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.504382  normal  0.828947 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0567  hypothetical protein  25.77 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0576914  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12740  hypothetical protein  26.96 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1677  peptidase C60 sortase A and B  27.41 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0763151  normal  0.0326953 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08150  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  57  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.447744  hitchhiker  0.0000000316905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>