More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2784 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_03832  translation elongation factor G1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08110)  51.99 
 
 
799 aa  756    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  48.19 
 
 
692 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1049  elongation factor G  63.58 
 
 
695 aa  955    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00560945  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  48.76 
 
 
691 aa  648    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  48.33 
 
 
691 aa  648    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  49.64 
 
 
691 aa  654    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1660  elongation factor G  67.16 
 
 
695 aa  965    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.264114  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  49.64 
 
 
691 aa  654    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  48.56 
 
 
700 aa  639    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  47.62 
 
 
698 aa  635    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01520  elongation factor g 1, mitochondrial precursor (mef-g-1), putative  54.24 
 
 
811 aa  773    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.671168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  48.47 
 
 
689 aa  641    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  47.34 
 
 
696 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32800  predicted protein  58.79 
 
 
700 aa  827    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2166  translation elongation factor G  52.76 
 
 
710 aa  757    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  50.22 
 
 
691 aa  664    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1583  elongation factor G  66.47 
 
 
694 aa  966    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.93602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  48.41 
 
 
692 aa  639    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0548  translation elongation factor G  65.75 
 
 
695 aa  976    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39465  predicted protein  51.95 
 
 
745 aa  713    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  unclonable  0.000000268657 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2292  elongation factor G  66.47 
 
 
694 aa  967    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1778  translation elongation factor G  50.59 
 
 
682 aa  687    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  47.46 
 
 
692 aa  635    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2813  elongation factor G  68.77 
 
 
695 aa  982    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115924  normal  0.668258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  49.2 
 
 
692 aa  645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  49.64 
 
 
691 aa  653    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  47.63 
 
 
709 aa  640    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000111702  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1934  elongation factor G  66.23 
 
 
693 aa  960    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2784  elongation factor G  100 
 
 
696 aa  1439    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.621972  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  49.64 
 
 
700 aa  654    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  49.05 
 
 
691 aa  647    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0550  elongation factor G  65.32 
 
 
693 aa  954    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.276809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  46.39 
 
 
697 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  48.34 
 
 
692 aa  634  1e-180  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  47.92 
 
 
708 aa  632  1e-180  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365208  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  48.26 
 
 
689 aa  634  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  47.67 
 
 
692 aa  635  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  48.41 
 
 
706 aa  632  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  47.73 
 
 
697 aa  634  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  47.76 
 
 
700 aa  633  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  47.38 
 
 
688 aa  634  1e-180  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  47.78 
 
 
708 aa  632  1e-180  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  48.33 
 
 
691 aa  632  1e-180  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  48.19 
 
 
692 aa  632  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  47.64 
 
 
703 aa  633  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0277  elongation factor G  48.13 
 
 
702 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0695  elongation factor G  48.03 
 
 
694 aa  629  1e-179  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000135868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  47.97 
 
 
692 aa  631  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  48.06 
 
 
697 aa  630  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  47.32 
 
 
698 aa  630  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  48.62 
 
 
692 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  47.61 
 
 
692 aa  631  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0753  elongation factor G  47.32 
 
 
713 aa  630  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.026843  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  46.36 
 
 
693 aa  629  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3919  elongation factor G  48.13 
 
 
702 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000296872  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0663  elongation factor G  48.03 
 
 
694 aa  629  1e-179  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000168111  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4918  translation elongation factor G  49.2 
 
 
699 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.935867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  48.33 
 
 
692 aa  631  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3675  elongation factor G  48.13 
 
 
702 aa  630  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000179981  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  48.12 
 
 
691 aa  629  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03191  elongation factor EF-2  46.7 
 
 
704 aa  626  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000806084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0373  translation elongation factor G  46.7 
 
 
704 aa  626  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000927424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3536  elongation factor G  46.7 
 
 
704 aa  626  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352954  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4549  elongation factor G  46.7 
 
 
704 aa  625  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000485563  normal  0.0800773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  47.41 
 
 
695 aa  626  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3714  elongation factor G  46.7 
 
 
704 aa  626  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000497299  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3809  elongation factor G  46.7 
 
 
704 aa  626  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225417  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0796  elongation factor G  46.32 
 
 
695 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0475216  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0770  elongation factor G  46.18 
 
 
695 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03142  hypothetical protein  46.7 
 
 
704 aa  626  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000869539  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3621  elongation factor G  46.7 
 
 
704 aa  626  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000194361  hitchhiker  0.000724432 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4649  elongation factor G  46.7 
 
 
704 aa  626  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000344499  normal  0.01673 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1645  elongation factor G  47.71 
 
 
700 aa  625  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  47.97 
 
 
692 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1083  translation elongation factor G  48.06 
 
 
699 aa  628  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488496  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0373  elongation factor G  46.7 
 
 
704 aa  626  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000419107  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4279  translation elongation factor G  47.26 
 
 
697 aa  627  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000062878  unclonable  0.0000000000098696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  47.48 
 
 
699 aa  628  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  47.91 
 
 
699 aa  625  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  47.06 
 
 
700 aa  625  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  48.26 
 
 
689 aa  625  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  48.08 
 
 
704 aa  622  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0400  elongation factor G  47.27 
 
 
704 aa  624  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000255179  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3341  elongation factor G  47.49 
 
 
699 aa  624  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000527224  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  47.21 
 
 
703 aa  622  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  46.72 
 
 
691 aa  622  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  46.25 
 
 
699 aa  624  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  48.35 
 
 
698 aa  623  1e-177  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2537  translation elongation factor G  47.56 
 
 
701 aa  620  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  47.48 
 
 
699 aa  620  1e-176  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0388  elongation factor G  47.76 
 
 
702 aa  620  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00665506  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20910  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  46.7 
 
 
702 aa  620  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.357835  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  46.47 
 
 
696 aa  621  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  46.56 
 
 
700 aa  619  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  48.2 
 
 
690 aa  619  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  46.33 
 
 
699 aa  619  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0687  translation elongation factor G  47.6 
 
 
692 aa  620  1e-176  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  46.79 
 
 
691 aa  621  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  47.02 
 
 
698 aa  620  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  46.6 
 
 
698 aa  620  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>