More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0400 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03191  elongation factor EF-2  95.45 
 
 
704 aa  1395    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000806084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0373  translation elongation factor G  95.45 
 
 
704 aa  1395    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000927424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  66.24 
 
 
692 aa  947    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0451  elongation factor G  66.95 
 
 
715 aa  979    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163293  unclonable  0.000000517484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4111  elongation factor G  68.41 
 
 
703 aa  995    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  71.86 
 
 
698 aa  1025    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  73.44 
 
 
703 aa  1060    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0804  elongation factor G  73.44 
 
 
700 aa  1038    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.0692379 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  63 
 
 
692 aa  877    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  70.7 
 
 
699 aa  1035    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  64.67 
 
 
691 aa  929    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  60.14 
 
 
692 aa  841    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  71.69 
 
 
698 aa  1038    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0623  translation elongation factor G  68.18 
 
 
701 aa  979    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  63.14 
 
 
692 aa  879    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  63.14 
 
 
692 aa  879    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl622  elongation factor G  59.66 
 
 
689 aa  842    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  63.43 
 
 
692 aa  882    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  73.62 
 
 
704 aa  1030    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  73.62 
 
 
700 aa  1065    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  70.63 
 
 
694 aa  1026    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  70.49 
 
 
694 aa  1025    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4551  elongation factor G  68.32 
 
 
701 aa  980    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0946111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  69.14 
 
 
708 aa  1006    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365208  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0316  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  70.98 
 
 
697 aa  1009    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000146619  hitchhiker  0.000265017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  59.86 
 
 
704 aa  850    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1075  elongation factor G  59.8 
 
 
691 aa  838    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3183  elongation factor G  73.48 
 
 
702 aa  1062    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0250795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5535  elongation factor G  73.01 
 
 
701 aa  1031    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.873781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  71.82 
 
 
696 aa  1032    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1361  elongation factor G  59.17 
 
 
690 aa  828    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  59.94 
 
 
692 aa  858    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1105  elongation factor G  73.62 
 
 
704 aa  1030    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00766491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  73.62 
 
 
700 aa  1065    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  70.86 
 
 
697 aa  1021    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5082  elongation factor G  68.61 
 
 
701 aa  993    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000061463  normal  0.350289 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  63.09 
 
 
692 aa  917    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3444  elongation factor G  73.48 
 
 
700 aa  1062    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000177525  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5860  elongation factor G  73.27 
 
 
701 aa  1027    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176276  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  62.93 
 
 
704 aa  908    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  59.8 
 
 
691 aa  842    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  62.78 
 
 
704 aa  912    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  60.8 
 
 
691 aa  856    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  66.81 
 
 
692 aa  953    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2261  elongation factor G  60.6 
 
 
693 aa  830    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00174872  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0292  translation elongation factor G  70.67 
 
 
700 aa  1013    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000300154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  63.14 
 
 
692 aa  879    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0357  elongation factor G  61.56 
 
 
696 aa  868    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  60.37 
 
 
691 aa  855    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  58.4 
 
 
694 aa  840    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  71.08 
 
 
696 aa  1019    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0153  elongation factor G  58.52 
 
 
689 aa  835    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2691  elongation factor G  61.46 
 
 
692 aa  855    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  64.81 
 
 
692 aa  926    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0756  elongation factor G  73.62 
 
 
704 aa  1030    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  73.62 
 
 
700 aa  1065    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  62.5 
 
 
697 aa  893    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  60.94 
 
 
698 aa  858    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2292  elongation factor G  59.31 
 
 
690 aa  835    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1246  elongation factor G  61.15 
 
 
690 aa  848    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3798  elongation factor G  70.07 
 
 
700 aa  1008    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000136641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0928  elongation factor G  67.47 
 
 
701 aa  971    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.082436  hitchhiker  0.00424173 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  71.12 
 
 
697 aa  1021    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  71.06 
 
 
700 aa  1039    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4287  elongation factor G  70.07 
 
 
704 aa  1010    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  73.76 
 
 
700 aa  1071    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  73.23 
 
 
701 aa  1036    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  71.55 
 
 
698 aa  1023    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3187  elongation factor G  59.31 
 
 
690 aa  832    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  67 
 
 
706 aa  978    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  69.14 
 
 
708 aa  1004    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3325  elongation factor G  73.62 
 
 
703 aa  1063    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.888468  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5930  elongation factor G  73.44 
 
 
702 aa  1031    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955652  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0494  translation elongation factor G  76.85 
 
 
705 aa  1121    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  60.09 
 
 
697 aa  862    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2821  elongation factor G  61.17 
 
 
697 aa  860    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.114421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1916  elongation factor G  73.76 
 
 
747 aa  1031    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2762  elongation factor G  73.48 
 
 
700 aa  1065    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608809  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  59.2 
 
 
701 aa  839    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  59.05 
 
 
715 aa  842    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0602  translation elongation factor G  72.97 
 
 
701 aa  1051    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000132615  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2717  elongation factor G  61.36 
 
 
688 aa  864    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2403  elongation factor G  61.22 
 
 
688 aa  860    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149937  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1645  elongation factor G  83.95 
 
 
700 aa  1207    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562984  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  59.01 
 
 
691 aa  848    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  72.26 
 
 
698 aa  1052    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  72.26 
 
 
698 aa  1052    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0455  elongation factor G  71.43 
 
 
699 aa  993    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  71.41 
 
 
698 aa  1040    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1798  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  60.23 
 
 
691 aa  836    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.287581  normal  0.0715825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  73.33 
 
 
700 aa  1061    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2576  elongation factor G  73.55 
 
 
703 aa  1033    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.275425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08820  elongation factor G  68.98 
 
 
706 aa  999    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.569469  normal  0.0264606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37710  elongation factor G  68.98 
 
 
702 aa  1001    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  59.57 
 
 
693 aa  835    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2980  elongation factor G  59.49 
 
 
713 aa  828    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0345  elongation factor G  73.62 
 
 
700 aa  1067    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2528  elongation factor G  73.83 
 
 
703 aa  1037    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  62.18 
 
 
692 aa  882    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  72.26 
 
 
698 aa  1053    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>