More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2166 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03832  translation elongation factor G1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08110)  48.12 
 
 		 799 aa  669    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03191  elongation factor EF-2  48.1 
 
 		 704 aa  641    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000806084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0373  translation elongation factor G  48.1 
 
 		 704 aa  641    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000927424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  48.65 
 
 		 692 aa  650    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1049  elongation factor G  53.39 
 
 		 695 aa  771    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00560945  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2102  elongation factor G  47.27 
 
 		 705 aa  637    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.990923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  47.4 
 
 		 704 aa  635    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3828  elongation factor G  48.52 
 
 		 704 aa  637    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000816604  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3714  elongation factor G  48.1 
 
 		 704 aa  641    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000497299  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  49.07 
 
 		 691 aa  644    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3675  elongation factor G  48.66 
 
 		 702 aa  643    Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000179981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1934  elongation factor G  54.47 
 
 		 693 aa  769    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  49.07 
 
 		 691 aa  643    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1583  elongation factor G  53.84 
 
 		 694 aa  738    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.93602  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01520  elongation factor g 1, mitochondrial precursor (mef-g-1), putative  46.69 
 
 		 811 aa  677    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.671168  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3621  elongation factor G  48.1 
 
 		 704 aa  641    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000194361  hitchhiker  0.000724432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  48.03 
 
 		 704 aa  639    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0550  elongation factor G  53.72 
 
 		 693 aa  763    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.276809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3809  elongation factor G  48.1 
 
 		 704 aa  641    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4007  elongation factor G  48.66 
 
 		 704 aa  638    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000280538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4549  elongation factor G  48.24 
 
 		 704 aa  644    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000485563  normal  0.0800773 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0277  elongation factor G  48.66 
 
 		 702 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  48.3 
 
 		 699 aa  645    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  46.64 
 
 		 691 aa  638    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  48.12 
 
 		 704 aa  642    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  46.64 
 
 		 691 aa  637    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  48.58 
 
 		 692 aa  644    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  48.72 
 
 		 694 aa  654    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2192  elongation factor G  47.12 
 
 		 705 aa  635    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.857068  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0373  elongation factor G  48.1 
 
 		 704 aa  641    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000419107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  47.49 
 
 		 691 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  47.49 
 
 		 691 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2292  elongation factor G  53.98 
 
 		 694 aa  736    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  47.93 
 
 		 689 aa  635    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0050  elongation factor G  47.35 
 
 		 691 aa  635    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39465  predicted protein  46.84 
 
 		 745 aa  653    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.000000268657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1778  translation elongation factor G  49.86 
 
 		 682 aa  690    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  48.15 
 
 		 692 aa  640    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  47.65 
 
 		 692 aa  641    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1660  elongation factor G  53.98 
 
 		 695 aa  744    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.264114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0548  translation elongation factor G  54.35 
 
 		 695 aa  765    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  48.3 
 
 		 692 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2166  translation elongation factor G  100 
 
 		 710 aa  1467    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  46.31 
 
 		 697 aa  638    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  47.5 
 
 		 691 aa  639    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  48.44 
 
 		 692 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  48.57 
 
 		 691 aa  642    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0400  elongation factor G  47.96 
 
 		 704 aa  636    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000255179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  49.36 
 
 		 692 aa  654    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03142  hypothetical protein  48.1 
 
 		 704 aa  641    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000869539  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  48.71 
 
 		 688 aa  639    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  49.07 
 
 		 691 aa  645    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2813  elongation factor G  53.98 
 
 		 695 aa  742    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115924  normal  0.668258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4649  elongation factor G  48.1 
 
 		 704 aa  641    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000344499  normal  0.01673 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32800  predicted protein  52.43 
 
 		 700 aa  729    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  47.57 
 
 		 692 aa  640    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2784  elongation factor G  52.76 
 
 		 696 aa  757    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.621972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3919  elongation factor G  48.66 
 
 		 702 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000296872  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  49.44 
 
 		 700 aa  657    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  48.22 
 
 		 691 aa  642    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  48.86 
 
 		 692 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  48.52 
 
 		 703 aa  641    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3536  elongation factor G  48.1 
 
 		 704 aa  641    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352954  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3814  elongation factor G  48.1 
 
 		 704 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3643  elongation factor G  48.1 
 
 		 704 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661479  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  47.43 
 
 		 692 aa  634  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3716  elongation factor G  48.1 
 
 		 704 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0927216  normal  0.0969109 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3642  elongation factor G  48.1 
 
 		 704 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  47 
 
 		 692 aa  635  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  47.96 
 
 		 700 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000646434  hitchhiker  0.000000000415866 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3751  elongation factor G  48.1 
 
 		 704 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.491712  normal  0.0846164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  46.36 
 
 		 691 aa  634  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2426  elongation factor G  47.32 
 
 		 704 aa  633  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  48.53 
 
 		 705 aa  633  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3757  elongation factor G  48.38 
 
 		 704 aa  631  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000182593  decreased coverage  0.00156911 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  46.92 
 
 		 691 aa  630  1e-179  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  46.61 
 
 		 708 aa  631  1e-179  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365208  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1075  elongation factor G  46.07 
 
 		 691 aa  628  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0753  elongation factor G  48.06 
 
 		 713 aa  629  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.026843  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0318  elongation factor G  48.11 
 
 		 704 aa  630  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000130884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  46.88 
 
 		 704 aa  632  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19501  elongation factor G  46.21 
 
 		 691 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  47.82 
 
 		 700 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  46.93 
 
 		 693 aa  630  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00002423  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  46.61 
 
 		 708 aa  629  1e-179  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  48.58 
 
 		 699 aa  630  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  48.24 
 
 		 704 aa  631  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  47.83 
 
 		 700 aa  626  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  47.52 
 
 		 704 aa  625  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  47.54 
 
 		 700 aa  628  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  45.92 
 
 		 691 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  45.78 
 
 		 691 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  46.89 
 
 		 696 aa  627  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  47.33 
 
 		 700 aa  625  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  45.74 
 
 		 691 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  47.43 
 
 		 698 aa  625  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  47.68 
 
 		 700 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0345  elongation factor G  47.4 
 
 		 700 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  47.3 
 
 		 700 aa  625  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  48.58 
 
 		 691 aa  625  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>