More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1934 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_03832  translation elongation factor G1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08110)  52.01 
 
 
799 aa  720    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1049  elongation factor G  62.52 
 
 
695 aa  917    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00560945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1583  elongation factor G  64.45 
 
 
694 aa  911    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.93602  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  50.36 
 
 
691 aa  666    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  50.22 
 
 
691 aa  659    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2166  translation elongation factor G  54.47 
 
 
710 aa  769    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01520  elongation factor g 1, mitochondrial precursor (mef-g-1), putative  53.57 
 
 
811 aa  769    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.671168  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  49.28 
 
 
692 aa  642    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1660  elongation factor G  65.01 
 
 
695 aa  910    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.264114  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  50.07 
 
 
691 aa  657    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1934  elongation factor G  100 
 
 
693 aa  1424    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  48.1 
 
 
692 aa  638    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0753  elongation factor G  48.8 
 
 
713 aa  635    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.026843  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2292  elongation factor G  64.31 
 
 
694 aa  912    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1778  translation elongation factor G  51.25 
 
 
682 aa  702    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0550  elongation factor G  62.19 
 
 
693 aa  901    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.276809  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  48.9 
 
 
692 aa  642    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39465  predicted protein  53.01 
 
 
745 aa  739    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  unclonable  0.000000268657 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  48.47 
 
 
692 aa  639    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2813  elongation factor G  65.07 
 
 
695 aa  920    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115924  normal  0.668258 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  48.26 
 
 
691 aa  638    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  50.22 
 
 
691 aa  659    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32800  predicted protein  56.8 
 
 
700 aa  787    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0548  translation elongation factor G  65.01 
 
 
695 aa  931    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2784  elongation factor G  66.23 
 
 
696 aa  960    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.621972  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  49.49 
 
 
691 aa  644    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  48.41 
 
 
696 aa  634  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  47.36 
 
 
691 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  47.51 
 
 
691 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  48.34 
 
 
697 aa  633  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  47.6 
 
 
691 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  47.6 
 
 
691 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  48.42 
 
 
700 aa  632  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  47.21 
 
 
691 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  48.32 
 
 
694 aa  628  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0687  translation elongation factor G  49.71 
 
 
692 aa  630  1e-179  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3675  elongation factor G  48.91 
 
 
702 aa  628  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000179981  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0277  elongation factor G  48.91 
 
 
702 aa  628  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  48.83 
 
 
698 aa  629  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  49.42 
 
 
689 aa  630  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3919  elongation factor G  48.91 
 
 
702 aa  628  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000296872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  47.77 
 
 
703 aa  630  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  48.39 
 
 
692 aa  628  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  47.28 
 
 
697 aa  625  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0357  elongation factor G  47.78 
 
 
696 aa  627  1e-178  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16891  elongation factor G  47.21 
 
 
691 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.900412  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  47.21 
 
 
691 aa  622  1e-177  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  47.97 
 
 
698 aa  622  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  46.95 
 
 
691 aa  622  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  47.21 
 
 
691 aa  623  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  47.26 
 
 
699 aa  619  1e-176  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  47.69 
 
 
699 aa  618  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  47.13 
 
 
699 aa  620  1e-176  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  47.88 
 
 
692 aa  620  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  48.56 
 
 
698 aa  620  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1083  translation elongation factor G  48.4 
 
 
699 aa  620  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488496  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  47.71 
 
 
697 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  47.38 
 
 
695 aa  621  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  46.45 
 
 
693 aa  620  1e-176  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  48.53 
 
 
692 aa  620  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  47.65 
 
 
691 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  48.2 
 
 
700 aa  620  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  48.25 
 
 
692 aa  616  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  46.64 
 
 
694 aa  617  1e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  47.92 
 
 
704 aa  616  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1075  elongation factor G  47.8 
 
 
691 aa  618  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  48.04 
 
 
700 aa  616  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  47.65 
 
 
691 aa  617  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  48.1 
 
 
692 aa  615  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  49.13 
 
 
690 aa  615  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  47.36 
 
 
691 aa  618  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  47.23 
 
 
691 aa  617  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19501  elongation factor G  47.8 
 
 
691 aa  618  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1645  elongation factor G  48.18 
 
 
700 aa  615  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562984  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  48.1 
 
 
688 aa  616  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  47.53 
 
 
689 aa  616  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  47.31 
 
 
691 aa  615  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0050  elongation factor G  48.39 
 
 
691 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03191  elongation factor EF-2  47.62 
 
 
704 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000806084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0373  translation elongation factor G  47.62 
 
 
704 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000927424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3621  elongation factor G  47.62 
 
 
704 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000194361  hitchhiker  0.000724432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2733  translation elongation factor G  47.5 
 
 
691 aa  613  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.167208 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3714  elongation factor G  47.62 
 
 
704 aa  613  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000497299  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3536  elongation factor G  47.62 
 
 
704 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352954  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0373  elongation factor G  47.62 
 
 
704 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000419107  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  46.49 
 
 
694 aa  615  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03142  hypothetical protein  47.62 
 
 
704 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000869539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  48.09 
 
 
692 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4649  elongation factor G  47.62 
 
 
704 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000344499  normal  0.01673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  46.59 
 
 
699 aa  612  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  47.98 
 
 
700 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3809  elongation factor G  47.62 
 
 
704 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1337  translation elongation factor G  47.81 
 
 
700 aa  610  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  47.35 
 
 
697 aa  611  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  47.16 
 
 
697 aa  608  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  46.91 
 
 
696 aa  610  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  47.84 
 
 
700 aa  609  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1798  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  48.03 
 
 
691 aa  611  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.287581  normal  0.0715825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2307  translation elongation factor G  47.51 
 
 
700 aa  608  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  47.22 
 
 
691 aa  609  1e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>