39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2750 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2750  putative lipoprotein  100 
 
 		 131 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0134689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1165  putative lipoprotein  64.86 
 
 		 132 aa  156  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2999  putative lipoprotein  62.39 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2853  putative lipoprotein  62.39 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.547961  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1506  lipoprotein, putative  62.39 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2870  putative lipoprotein  62.39 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.955293  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2515  putative lipoprotein  62.39 
 
 		 126 aa  144  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.304337  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1401  putative lipoprotein  59.5 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.660472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2859  putative lipoprotein  60.98 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.684176  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3240  putative lipoprotein  53.57 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.435934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1348  putative lipoprotein  61.47 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.015977 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1413  putative lipoprotein  61.47 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.783561  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3150  putative lipoprotein  59.63 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1441  putative lipoprotein  57.27 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2588  putative lipoprotein  57.27 
 
 		 138 aa  117  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2541  putative lipoprotein  56.14 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000507859  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3286  putative lipoprotein  40.5 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000316445  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2840  putative rcsF protein  32.31 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0266  outer membrane lipoprotein  36.05 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0968818  normal  0.298667 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0266  outer membrane lipoprotein  36.05 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.358577  normal  0.824485 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0285  outer membrane lipoprotein  36.05 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000747174  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0282  outer membrane lipoprotein  36.05 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.301931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0207  outer membrane lipoprotein  35.37 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0734  outer membrane lipoprotein  39.71 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0102755  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3406  outer membrane lipoprotein  32.56 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000353754  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0190  outer membrane lipoprotein  32.56 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00194  hypothetical protein  32.56 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0103949  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3463  outer membrane lipoprotein  32.56 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3756  outer membrane lipoprotein  34.88 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253291  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0203  outer membrane lipoprotein  32.56 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000578767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00195  predicted outer membrane protein, signal  32.56 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0127715  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0208  outer membrane lipoprotein  34.15 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.526616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0200  outer membrane lipoprotein  31.4 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00727312  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1093  outer membrane lipoprotein  34.88 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.42341  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1040  outer membrane lipoprotein  34.88 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000751128  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0875  outer membrane lipoprotein  32.53 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0373988  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0844  outer membrane lipoprotein  31.33 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000633967  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3502  outer membrane lipoprotein  31.46 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00358742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3345  outer membrane lipoprotein  32.53 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00047922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>