36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1040 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1040  outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000751128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1093  outer membrane lipoprotein  99.26 
 
 		 135 aa  270  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.42341  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0734  outer membrane lipoprotein  64.96 
 
 		 134 aa  181  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0102755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0266  outer membrane lipoprotein  67.41 
 
 		 134 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.358577  normal  0.824485 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0285  outer membrane lipoprotein  67.41 
 
 		 134 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000747174  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0282  outer membrane lipoprotein  67.41 
 
 		 134 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.301931 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0266  outer membrane lipoprotein  67.41 
 
 		 134 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0968818  normal  0.298667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3756  outer membrane lipoprotein  73.39 
 
 		 134 aa  177  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253291  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0200  outer membrane lipoprotein  64.23 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00727312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3406  outer membrane lipoprotein  64.23 
 
 		 134 aa  174  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000353754  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00195  predicted outer membrane protein, signal  64.23 
 
 		 134 aa  174  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0127715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00194  hypothetical protein  64.23 
 
 		 134 aa  174  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0103949  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0190  outer membrane lipoprotein  64.23 
 
 		 134 aa  174  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374063  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3463  outer membrane lipoprotein  64.23 
 
 		 134 aa  174  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0203  outer membrane lipoprotein  64.23 
 
 		 134 aa  174  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000578767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3502  outer membrane lipoprotein  61.43 
 
 		 136 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00358742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3345  outer membrane lipoprotein  59.29 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00047922  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0844  outer membrane lipoprotein  59.26 
 
 		 135 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000633967  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0875  outer membrane lipoprotein  61.87 
 
 		 135 aa  154  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0373988  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0208  outer membrane lipoprotein  70.87 
 
 		 117 aa  152  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.526616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0207  outer membrane lipoprotein  69.9 
 
 		 117 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3408  putative lipoprotein  100 
 
 		 43 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0474152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0271  exopolysaccharide synthesis regulator RcsF  79.07 
 
 		 43 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0638658 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3286  putative lipoprotein  29.89 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000316445  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1165  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2750  putative lipoprotein  34.88 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0134689  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1441  putative lipoprotein  37.68 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2515  putative lipoprotein  32.35 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.304337  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2999  putative lipoprotein  28.89 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1506  lipoprotein, putative  28.89 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2853  putative lipoprotein  28.89 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.547961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3240  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.435934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2870  putative lipoprotein  28.89 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.955293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2840  putative rcsF protein  27.48 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2859  putative lipoprotein  32.56 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.684176  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2588  putative lipoprotein  37.68 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>