34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2840 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2840  putative rcsF protein  100 
 
 		 140 aa  291  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3286  putative lipoprotein  31.82 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000316445  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1165  putative lipoprotein  36.84 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3240  putative lipoprotein  36.52 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.435934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2515  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.304337  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1506  lipoprotein, putative  32.43 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2870  putative lipoprotein  32.43 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.955293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2999  putative lipoprotein  32.43 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2853  putative lipoprotein  32.43 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.547961  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2588  putative lipoprotein  41.28 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2859  putative lipoprotein  38.89 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.684176  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1401  putative lipoprotein  31.09 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.660472 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1441  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1413  putative lipoprotein  31.25 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.783561  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1348  putative lipoprotein  31.25 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.015977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2541  putative lipoprotein  33.83 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000507859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2750  putative lipoprotein  32.52 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0134689  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3150  putative lipoprotein  34.23 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0266  outer membrane lipoprotein  30.77 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.358577  normal  0.824485 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0285  outer membrane lipoprotein  30.77 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000747174  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0282  outer membrane lipoprotein  30.77 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.301931 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0266  outer membrane lipoprotein  30.77 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0968818  normal  0.298667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0734  outer membrane lipoprotein  29.23 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0102755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0200  outer membrane lipoprotein  28.68 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00727312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3406  outer membrane lipoprotein  28.68 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000353754  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00194  hypothetical protein  28.68 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0103949  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0190  outer membrane lipoprotein  28.68 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374063  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3463  outer membrane lipoprotein  28.68 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0203  outer membrane lipoprotein  28.68 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000578767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00195  predicted outer membrane protein, signal  28.68 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0127715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3502  outer membrane lipoprotein  32.47 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00358742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3345  outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00047922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0208  outer membrane lipoprotein  31.4 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.526616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0207  outer membrane lipoprotein  30.23 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>