36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0734 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0734  outer membrane lipoprotein  100 
 
 
134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0102755  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0266  outer membrane lipoprotein  88.81 
 
 
134 aa  252  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0968818  normal  0.298667 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0266  outer membrane lipoprotein  88.81 
 
 
134 aa  252  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.358577  normal  0.824485 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0285  outer membrane lipoprotein  88.81 
 
 
134 aa  252  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000747174  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0282  outer membrane lipoprotein  88.81 
 
 
134 aa  252  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.301931 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3406  outer membrane lipoprotein  85.82 
 
 
134 aa  243  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000353754  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3463  outer membrane lipoprotein  85.82 
 
 
134 aa  243  9e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0203  outer membrane lipoprotein  85.82 
 
 
134 aa  243  9e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000578767  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0190  outer membrane lipoprotein  85.82 
 
 
134 aa  243  9e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00194  hypothetical protein  85.82 
 
 
134 aa  243  9e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0103949  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00195  predicted outer membrane protein, signal  85.82 
 
 
134 aa  243  9e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0127715  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0200  outer membrane lipoprotein  85.07 
 
 
134 aa  241  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00727312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0208  outer membrane lipoprotein  84.62 
 
 
117 aa  210  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.526616  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0207  outer membrane lipoprotein  83.76 
 
 
117 aa  209  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160957  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1040  outer membrane lipoprotein  64.96 
 
 
135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000751128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1093  outer membrane lipoprotein  64.23 
 
 
135 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.42341  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3756  outer membrane lipoprotein  61.98 
 
 
134 aa  152  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253291  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3502  outer membrane lipoprotein  58.27 
 
 
136 aa  150  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00358742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0875  outer membrane lipoprotein  55.88 
 
 
135 aa  148  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0373988  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3345  outer membrane lipoprotein  55.88 
 
 
136 aa  147  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00047922  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0844  outer membrane lipoprotein  51.85 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000633967  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0271  exopolysaccharide synthesis regulator RcsF  86.05 
 
 
43 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0638658 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3408  putative lipoprotein  72.09 
 
 
43 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0474152  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3286  putative lipoprotein  26.72 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000316445  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3240  putative lipoprotein  29.32 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.435934  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2840  putative rcsF protein  29.23 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2750  putative lipoprotein  39.71 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0134689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1165  putative lipoprotein  35.29 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2853  putative lipoprotein  35.94 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.547961  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1506  lipoprotein, putative  35.94 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2870  putative lipoprotein  35.94 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.955293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2999  putative lipoprotein  35.94 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1441  putative lipoprotein  37.68 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2515  putative lipoprotein  34.38 
 
 
126 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.304337  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2541  putative lipoprotein  28.57 
 
 
130 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000507859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2859  putative lipoprotein  26.15 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.684176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>