36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0200 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0200  outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00727312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3406  outer membrane lipoprotein  99.25 
 
 		 134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000353754  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00195  predicted outer membrane protein, signal  99.25 
 
 		 134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0127715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3463  outer membrane lipoprotein  99.25 
 
 		 134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00194  hypothetical protein  99.25 
 
 		 134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0103949  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0190  outer membrane lipoprotein  99.25 
 
 		 134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0203  outer membrane lipoprotein  99.25 
 
 		 134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000578767  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0285  outer membrane lipoprotein  90.3 
 
 		 134 aa  250  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000747174  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0266  outer membrane lipoprotein  90.3 
 
 		 134 aa  250  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0968818  normal  0.298667 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0282  outer membrane lipoprotein  90.3 
 
 		 134 aa  250  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.301931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0266  outer membrane lipoprotein  90.3 
 
 		 134 aa  250  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.358577  normal  0.824485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0734  outer membrane lipoprotein  85.07 
 
 		 134 aa  241  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0102755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0208  outer membrane lipoprotein  99.15 
 
 		 117 aa  237  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.526616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0207  outer membrane lipoprotein  98.29 
 
 		 117 aa  236  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1040  outer membrane lipoprotein  64.23 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000751128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1093  outer membrane lipoprotein  63.5 
 
 		 135 aa  153  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.42341  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0875  outer membrane lipoprotein  56.43 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0373988  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3345  outer membrane lipoprotein  57.35 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00047922  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3502  outer membrane lipoprotein  54.61 
 
 		 136 aa  143  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00358742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3756  outer membrane lipoprotein  60.66 
 
 		 134 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253291  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0844  outer membrane lipoprotein  53.33 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000633967  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0271  exopolysaccharide synthesis regulator RcsF  93.02 
 
 		 43 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0638658 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3408  putative lipoprotein  74.42 
 
 		 43 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0474152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3240  putative lipoprotein  31.06 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.435934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3286  putative lipoprotein  24.43 
 
 		 144 aa  50.1  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000316445  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2750  putative lipoprotein  31.4 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0134689  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2840  putative rcsF protein  28.68 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1165  putative lipoprotein  27.91 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2859  putative lipoprotein  27.07 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.684176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2999  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1506  lipoprotein, putative  30.23 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2853  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.547961  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2870  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.955293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1441  putative lipoprotein  36.23 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2541  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000507859  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2515  putative lipoprotein  29.07 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.304337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>