30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1348 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1348  putative lipoprotein  100 
 
 		 126 aa  255  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.015977 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1413  putative lipoprotein  100 
 
 		 126 aa  255  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.783561  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1401  putative lipoprotein  98.41 
 
 		 126 aa  253  7e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.660472 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1506  lipoprotein, putative  88.89 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2999  putative lipoprotein  88.89 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2853  putative lipoprotein  88.89 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.547961  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2870  putative lipoprotein  88.89 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.955293  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2515  putative lipoprotein  86.51 
 
 		 126 aa  209  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.304337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3150  putative lipoprotein  96.83 
 
 		 126 aa  204  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1165  putative lipoprotein  60.98 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3240  putative lipoprotein  60.48 
 
 		 127 aa  154  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.435934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2859  putative lipoprotein  65 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.684176  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1441  putative lipoprotein  65.87 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2750  putative lipoprotein  60.33 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0134689  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2588  putative lipoprotein  64.86 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2541  putative lipoprotein  58.26 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000507859  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3286  putative lipoprotein  39.68 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000316445  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2840  putative rcsF protein  33.86 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1040  outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000751128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1093  outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.42341  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0875  outer membrane lipoprotein  33.82 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0373988  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3756  outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253291  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0844  outer membrane lipoprotein  32.35 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000633967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0207  outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0563  hypothetical protein  21.74 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0734  outer membrane lipoprotein  32.35 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0102755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0266  outer membrane lipoprotein  30.88 
 
 		 134 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0968818  normal  0.298667 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0282  outer membrane lipoprotein  30.88 
 
 		 134 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.301931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0285  outer membrane lipoprotein  30.88 
 
 		 134 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000747174  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0266  outer membrane lipoprotein  30.88 
 
 		 134 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.358577  normal  0.824485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>