43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2124 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1327  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1941  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.299802  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2124  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.532788  hitchhiker  0.000112059 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1360  hypothetical protein  98.73 
 
 		 79 aa  163  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1656  DinI family protein  75.95 
 
 		 79 aa  131  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3349  DinI family protein  65.82 
 
 		 79 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3246  DinI family protein  60.76 
 
 		 79 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.805397  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3108  DinI family protein  63.29 
 
 		 80 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117209  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1097  gifsy-2 prophage MsgA  76.19 
 
 		 63 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1131  gifsy-2 prophage MsgA  74.6 
 
 		 63 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.855624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2751  dinI family protein  61.84 
 
 		 80 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1454  dinI family protein  61.84 
 
 		 80 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389039  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2830  DinI family protein  61.84 
 
 		 80 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0719  hypothetical protein  70.73 
 
 		 41 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2469  putative MsgA-like virulence protein  51.56 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2428  putative homolog of virulence protein MsgA  44.93 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.851984  normal  0.370396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1895  DNA damage-inducible protein I  40.74 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324508  hitchhiker  0.000105732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2514  DNA damage-inducible protein I  37.5 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1674  DNA damage-inducible protein I  40.96 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0403  DNA damage-inducible protein I  40.96 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0124932 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1566  DNA damage-inducible protein I  40.96 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00521035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1612  DinI family protein  38.46 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110829  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2819  DNA damage-inducible protein I  37.5 
 
 		 79 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.856695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2483  virulence protein MsgA  45.45 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0296503 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2586  putative virulence protein MsgA  45.45 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0867466 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01057  DNA damage-inducible protein I  39.13 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2585  DinI family protein  39.13 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.534423  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1184  DNA damage-inducible protein I  39.13 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647938  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01065  hypothetical protein  39.13 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1184  DNA damage-inducible protein I  39.13 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1440  DNA damage-inducible protein I  39.13 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.398572  normal  0.0309658 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2539  DNA damage-inducible protein I  39.13 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0403017  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2068  DNA damage-inducible protein I  39.13 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348863  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2266  DNA damage-inducible protein I  39.13 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1576  DinI family protein  32.05 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0825386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1575  DinI family protein  34.94 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_11  putative DNA-damage-inducible protein  34.33 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.819389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1274  DNA damage-inducible protein I  37.68 
 
 		 81 aa  43.9  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.860825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2468  virulence protein  52.78 
 
 		 37 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0801549  hitchhiker  0.000681162 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2210  DNA damage-inducible protein I  36.23 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.212881  normal  0.27906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2026  DNA damage-inducible protein I  36.23 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1259  DNA damage-inducible protein I  36.23 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.414091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1230  DNA damage-inducible protein I  36.23 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280438  normal  0.360014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>