35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3246 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3246  DinI family protein  100 
 
 		 79 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.805397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3349  DinI family protein  82.28 
 
 		 79 aa  136  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2751  dinI family protein  68.42 
 
 		 80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2830  DinI family protein  68.42 
 
 		 80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1454  dinI family protein  68.42 
 
 		 80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389039  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3108  DinI family protein  65.82 
 
 		 80 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117209  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1360  hypothetical protein  62.03 
 
 		 79 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2124  hypothetical protein  60.76 
 
 		 79 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.532788  hitchhiker  0.000112059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1941  hypothetical protein  60.76 
 
 		 79 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.299802  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1327  hypothetical protein  60.76 
 
 		 79 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1656  DinI family protein  63.64 
 
 		 79 aa  108  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1097  gifsy-2 prophage MsgA  58.73 
 
 		 63 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1131  gifsy-2 prophage MsgA  57.14 
 
 		 63 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.855624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_11  putative DNA-damage-inducible protein  43.28 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.819389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0719  hypothetical protein  58.54 
 
 		 41 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1396  putative DNA-damage-inducible protein I (DinI)  39.66 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.598582  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2819  DNA damage-inducible protein I  35.71 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.856695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1895  DNA damage-inducible protein I  36.71 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324508  hitchhiker  0.000105732 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2068  DNA damage-inducible protein I  39.34 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348863  normal  0.143439 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01057  DNA damage-inducible protein I  39.34 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2585  DinI family protein  39.34 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.534423  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01065  hypothetical protein  39.34 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1440  DNA damage-inducible protein I  39.34 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.398572  normal  0.0309658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1184  DNA damage-inducible protein I  39.34 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647938  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1184  DNA damage-inducible protein I  39.34 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2539  DNA damage-inducible protein I  39.34 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0403017  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0403  DNA damage-inducible protein I  35.44 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0124932 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1566  DNA damage-inducible protein I  35.44 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00521035  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1674  DNA damage-inducible protein I  35.44 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2514  DNA damage-inducible protein I  33.9 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1612  DinI family protein  30.77 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110829  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2468  virulence protein  52.78 
 
 		 37 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0801549  hitchhiker  0.000681162 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2266  DNA damage-inducible protein I  37.7 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3116  hypothetical protein  27.16 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128035 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1575  DinI family protein  34.52 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.512058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>