36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2751 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2751  dinI family protein  100 
 
 		 80 aa  163  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1454  dinI family protein  100 
 
 		 80 aa  163  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389039  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2830  DinI family protein  100 
 
 		 80 aa  163  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3349  DinI family protein  69.62 
 
 		 79 aa  119  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3108  DinI family protein  71.05 
 
 		 80 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117209  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3246  DinI family protein  68.42 
 
 		 79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.805397  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1656  DinI family protein  64.47 
 
 		 79 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1360  hypothetical protein  61.84 
 
 		 79 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2124  hypothetical protein  61.84 
 
 		 79 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.532788  hitchhiker  0.000112059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1941  hypothetical protein  61.84 
 
 		 79 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.299802  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1327  hypothetical protein  61.84 
 
 		 79 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1097  gifsy-2 prophage MsgA  60.32 
 
 		 63 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1131  gifsy-2 prophage MsgA  58.73 
 
 		 63 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.855624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_11  putative DNA-damage-inducible protein  35.53 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.819389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2819  DNA damage-inducible protein I  33.75 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.856695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2514  DNA damage-inducible protein I  32.5 
 
 		 79 aa  52.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1895  DNA damage-inducible protein I  35 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324508  hitchhiker  0.000105732 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1566  DNA damage-inducible protein I  35.37 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00521035  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0403  DNA damage-inducible protein I  35.37 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0124932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1674  DNA damage-inducible protein I  35.37 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0719  hypothetical protein  52.63 
 
 		 41 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1612  DinI family protein  31.25 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110829  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1396  putative DNA-damage-inducible protein I (DinI)  30.26 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.598582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3116  hypothetical protein  28.75 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128035 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0870  hypothetical protein  30 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1274  DNA damage-inducible protein I  31.71 
 
 		 81 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.860825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3864  hypothetical protein  27.5 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2026  DNA damage-inducible protein I  30.49 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1259  DNA damage-inducible protein I  30.49 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.414091 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2210  DNA damage-inducible protein I  30.49 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.212881  normal  0.27906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5549  hypothetical protein  27.5 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3109  DinI family protein  27.85 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0209906  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1230  DNA damage-inducible protein I  30.49 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280438  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2468  virulence protein  52.78 
 
 		 37 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0801549  hitchhiker  0.000681162 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1100  hypothetical protein  26.25 
 
 		 82 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4489  DNA-damage-inducible protein  26.25 
 
 		 82 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347422  normal  0.0273979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>