29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3108 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3108  DinI family protein  100 
 
 		 80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117209  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1656  DinI family protein  70.89 
 
 		 79 aa  120  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2751  dinI family protein  71.05 
 
 		 80 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1454  dinI family protein  71.05 
 
 		 80 aa  117  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389039  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2830  DinI family protein  71.05 
 
 		 80 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3349  DinI family protein  66.23 
 
 		 79 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3246  DinI family protein  65.82 
 
 		 79 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.805397  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1360  hypothetical protein  63.29 
 
 		 79 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2124  hypothetical protein  63.29 
 
 		 79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.532788  hitchhiker  0.000112059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1941  hypothetical protein  63.29 
 
 		 79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.299802  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1327  hypothetical protein  63.29 
 
 		 79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1097  gifsy-2 prophage MsgA  63.49 
 
 		 63 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1131  gifsy-2 prophage MsgA  61.9 
 
 		 63 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.855624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0719  hypothetical protein  58.97 
 
 		 41 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_11  putative DNA-damage-inducible protein  31.65 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.819389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2819  DNA damage-inducible protein I  32.1 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.856695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1895  DNA damage-inducible protein I  35.9 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324508  hitchhiker  0.000105732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2514  DNA damage-inducible protein I  32.91 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1396  putative DNA-damage-inducible protein I (DinI)  37.5 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.598582  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1566  DNA damage-inducible protein I  33.75 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00521035  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1674  DNA damage-inducible protein I  33.75 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0403  DNA damage-inducible protein I  33.75 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0124932 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1612  DinI family protein  29.11 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110829  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3109  DinI family protein  30.77 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0209906  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1576  DinI family protein  26.92 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0825386  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2210  DNA damage-inducible protein I  30.86 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.212881  normal  0.27906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2026  DNA damage-inducible protein I  30.86 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1230  DNA damage-inducible protein I  30.86 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280438  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1259  DNA damage-inducible protein I  30.86 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.414091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>