57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2514 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2514  DNA damage-inducible protein I  100 
 
 		 79 aa  164  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2819  DNA damage-inducible protein I  93.67 
 
 		 79 aa  153  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.856695  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1612  DinI family protein  71.05 
 
 		 80 aa  124  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110829  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1576  DinI family protein  66.67 
 
 		 80 aa  120  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0825386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01057  DNA damage-inducible protein I  67.9 
 
 		 81 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01065  hypothetical protein  67.9 
 
 		 81 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1440  DNA damage-inducible protein I  67.9 
 
 		 81 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.398572  normal  0.0309658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2068  DNA damage-inducible protein I  67.9 
 
 		 81 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348863  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2539  DNA damage-inducible protein I  67.9 
 
 		 81 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0403017  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1184  DNA damage-inducible protein I  67.9 
 
 		 81 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1184  DNA damage-inducible protein I  67.9 
 
 		 81 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647938  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2585  DinI family protein  67.9 
 
 		 81 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.534423  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1575  DinI family protein  69.23 
 
 		 81 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2266  DNA damage-inducible protein I  66.67 
 
 		 81 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1895  DNA damage-inducible protein I  64.56 
 
 		 79 aa  114  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324508  hitchhiker  0.000105732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2210  DNA damage-inducible protein I  66.67 
 
 		 81 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.212881  normal  0.27906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2026  DNA damage-inducible protein I  66.67 
 
 		 81 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1230  DNA damage-inducible protein I  66.67 
 
 		 81 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280438  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1259  DNA damage-inducible protein I  66.67 
 
 		 81 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.414091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1274  DNA damage-inducible protein I  65.43 
 
 		 81 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.860825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1674  DNA damage-inducible protein I  65.43 
 
 		 81 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1566  DNA damage-inducible protein I  65.43 
 
 		 81 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00521035  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0403  DNA damage-inducible protein I  65.43 
 
 		 81 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0124932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1090  hypothetical protein  47.44 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148997 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2256  DinI family protein  50 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0395407  hitchhiker  0.000256191 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2831  hypothetical protein  47.37 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.656931 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1127  hypothetical protein  47.37 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157001  normal  0.695719 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3109  DinI family protein  46.15 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0209906  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1058  hypothetical protein  46.05 
 
 		 77 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.767989  decreased coverage  0.000000199344 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2279  hypothetical protein  46.05 
 
 		 77 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.42074  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3116  hypothetical protein  46.25 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128035 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1100  hypothetical protein  45 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4489  DNA-damage-inducible protein  45 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347422  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5549  hypothetical protein  43.75 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0870  hypothetical protein  45 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3864  hypothetical protein  43.75 
 
 		 82 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3349  DinI family protein  37.04 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1656  DinI family protein  36.92 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2751  dinI family protein  32.5 
 
 		 80 aa  52.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2830  DinI family protein  32.5 
 
 		 80 aa  52.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1454  dinI family protein  32.5 
 
 		 80 aa  52.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389039  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2782  DinI family protein  33.77 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.398825  hitchhiker  0.000224366 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2160  hypothetical protein  36.36 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.146724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2221  hypothetical protein  36.36 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.006117  hitchhiker  0.00000000000000288477 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00836  hypothetical protein  32.47 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.5903  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00827  Prophage protein  32.47 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.439708  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2124  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.532788  hitchhiker  0.000112059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1941  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.299802  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1327  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1360  hypothetical protein  37.04 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0920  dinI family protein  32.47 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0793544  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0038  protein ImpC  35.8 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.511285  normal  0.0568274 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_11  putative DNA-damage-inducible protein  30.26 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.819389  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3108  DinI family protein  32.91 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117209  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1396  putative DNA-damage-inducible protein I (DinI)  29.49 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.598582  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2781  DinI family protein  37.5 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000163675  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3246  DinI family protein  33.9 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.805397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>