56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1259 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1259  DNA damage-inducible protein I  100 
 
 		 81 aa  166  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.414091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1230  DNA damage-inducible protein I  100 
 
 		 81 aa  166  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280438  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2026  DNA damage-inducible protein I  100 
 
 		 81 aa  166  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2210  DNA damage-inducible protein I  100 
 
 		 81 aa  166  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.212881  normal  0.27906 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1274  DNA damage-inducible protein I  98.77 
 
 		 81 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.860825 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2539  DNA damage-inducible protein I  85.19 
 
 		 81 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0403017  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2068  DNA damage-inducible protein I  85.19 
 
 		 81 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348863  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1184  DNA damage-inducible protein I  85.19 
 
 		 81 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1184  DNA damage-inducible protein I  85.19 
 
 		 81 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647938  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1440  DNA damage-inducible protein I  85.19 
 
 		 81 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.398572  normal  0.0309658 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01065  hypothetical protein  85.19 
 
 		 81 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2585  DinI family protein  85.19 
 
 		 81 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.534423  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01057  DNA damage-inducible protein I  85.19 
 
 		 81 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2266  DNA damage-inducible protein I  83.95 
 
 		 81 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1575  DinI family protein  80.25 
 
 		 81 aa  137  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2514  DNA damage-inducible protein I  66.67 
 
 		 79 aa  114  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1576  DinI family protein  67.95 
 
 		 80 aa  111  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0825386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1612  DinI family protein  66.25 
 
 		 80 aa  111  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110829  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2819  DNA damage-inducible protein I  65.38 
 
 		 79 aa  110  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.856695  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1566  DNA damage-inducible protein I  62.82 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00521035  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1674  DNA damage-inducible protein I  62.82 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0403  DNA damage-inducible protein I  62.82 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0124932 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1895  DNA damage-inducible protein I  61.73 
 
 		 79 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324508  hitchhiker  0.000105732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2831  hypothetical protein  52.56 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.656931 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1127  hypothetical protein  52.56 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157001  normal  0.695719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1090  hypothetical protein  52.56 
 
 		 79 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148997 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2256  DinI family protein  50 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0395407  hitchhiker  0.000256191 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1058  hypothetical protein  51.28 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.767989  decreased coverage  0.000000199344 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2279  hypothetical protein  51.28 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.42074  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3109  DinI family protein  47.5 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0209906  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4489  DNA-damage-inducible protein  42.86 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347422  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1100  hypothetical protein  42.86 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3116  hypothetical protein  42.17 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5549  hypothetical protein  41.67 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3864  hypothetical protein  41.67 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0870  hypothetical protein  40.48 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2160  hypothetical protein  34.78 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.146724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2221  hypothetical protein  34.78 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.006117  hitchhiker  0.00000000000000288477 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3504  DinI family protein  33.33 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0840838 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2782  DinI family protein  30.38 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.398825  hitchhiker  0.000224366 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0920  dinI family protein  29.11 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0793544  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00836  hypothetical protein  29.11 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.5903  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0038  protein ImpC  34.57 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.511285  normal  0.0568274 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00827  Prophage protein  29.11 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.439708  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1656  DinI family protein  35.82 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1941  hypothetical protein  36.23 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.299802  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2124  hypothetical protein  36.23 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.532788  hitchhiker  0.000112059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1327  hypothetical protein  36.23 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1360  hypothetical protein  36.23 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_11  putative DNA-damage-inducible protein  30.77 
 
 		 99 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.819389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2751  dinI family protein  30.49 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2781  DinI family protein  34.85 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000163675  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1454  dinI family protein  30.49 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389039  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2830  DinI family protein  30.49 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3108  DinI family protein  30.86 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117209  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3349  DinI family protein  33.75 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>