45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3349 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3349  DinI family protein  100 
 
 
79 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3246  DinI family protein  82.28 
 
 
79 aa  136  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.805397  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2751  dinI family protein  69.62 
 
 
80 aa  119  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1454  dinI family protein  69.62 
 
 
80 aa  119  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389039  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2830  DinI family protein  69.62 
 
 
80 aa  119  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1360  hypothetical protein  67.09 
 
 
79 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2124  hypothetical protein  65.82 
 
 
79 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.532788  hitchhiker  0.000112059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1941  hypothetical protein  65.82 
 
 
79 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.299802  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1327  hypothetical protein  65.82 
 
 
79 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1656  DinI family protein  65.82 
 
 
79 aa  117  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3108  DinI family protein  66.23 
 
 
80 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117209  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1097  gifsy-2 prophage MsgA  61.9 
 
 
63 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1131  gifsy-2 prophage MsgA  60.32 
 
 
63 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.855624  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2819  DNA damage-inducible protein I  39.51 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.856695  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_11  putative DNA-damage-inducible protein  40.3 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.819389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0719  hypothetical protein  58.54 
 
 
41 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2514  DNA damage-inducible protein I  37.04 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1895  DNA damage-inducible protein I  35.8 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324508  hitchhiker  0.000105732 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1674  DNA damage-inducible protein I  38.55 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0403  DNA damage-inducible protein I  38.55 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0124932 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1566  DNA damage-inducible protein I  38.55 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00521035  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1396  putative DNA-damage-inducible protein I (DinI)  40 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.598582  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1612  DinI family protein  32.05 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110829  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3109  DinI family protein  28.75 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0209906  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1440  DNA damage-inducible protein I  34.94 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.398572  normal  0.0309658 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01057  DNA damage-inducible protein I  34.94 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2539  DNA damage-inducible protein I  34.94 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0403017  normal  0.278127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2585  DinI family protein  34.94 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.534423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2068  DNA damage-inducible protein I  34.94 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348863  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01065  hypothetical protein  34.94 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1184  DNA damage-inducible protein I  34.94 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647938  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1184  DNA damage-inducible protein I  34.94 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2266  DNA damage-inducible protein I  33.73 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0870  hypothetical protein  28.75 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3116  hypothetical protein  28.75 
 
 
82 aa  42.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128035 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2256  DinI family protein  32.05 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0395407  hitchhiker  0.000256191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3864  hypothetical protein  27.5 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1575  DinI family protein  33.75 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1576  DinI family protein  26.92 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0825386  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2210  DNA damage-inducible protein I  33.75 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.212881  normal  0.27906 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1259  DNA damage-inducible protein I  33.75 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.414091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2026  DNA damage-inducible protein I  33.75 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1230  DNA damage-inducible protein I  33.75 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280438  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2468  virulence protein  50 
 
 
37 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0801549  hitchhiker  0.000681162 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5549  hypothetical protein  26.25 
 
 
82 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>