30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p320_11 on replicon NC_011314
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011314  VSAL_p320_11  putative DNA-damage-inducible protein  100 
 
 		 99 aa  205  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.819389  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1396  putative DNA-damage-inducible protein I (DinI)  68.42 
 
 		 76 aa  118  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.598582  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3246  DinI family protein  43.28 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.805397  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2751  dinI family protein  35.53 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1454  dinI family protein  35.53 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389039  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2830  DinI family protein  35.53 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3349  DinI family protein  40.3 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3108  DinI family protein  31.65 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117209  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1656  DinI family protein  35.71 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1576  DinI family protein  31.58 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0825386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2514  DNA damage-inducible protein I  30.26 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2819  DNA damage-inducible protein I  29.49 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.856695  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1612  DinI family protein  30.26 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110829  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1327  hypothetical protein  34.33 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1941  hypothetical protein  34.33 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.299802  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1360  hypothetical protein  34.33 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2124  hypothetical protein  34.33 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.532788  hitchhiker  0.000112059 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1575  DinI family protein  30.77 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2279  hypothetical protein  27.27 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.42074  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1058  hypothetical protein  27.27 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.767989  decreased coverage  0.000000199344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1895  DNA damage-inducible protein I  26.32 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324508  hitchhiker  0.000105732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1090  hypothetical protein  25.64 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148997 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2210  DNA damage-inducible protein I  30.77 
 
 		 81 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.212881  normal  0.27906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2026  DNA damage-inducible protein I  30.77 
 
 		 81 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1259  DNA damage-inducible protein I  30.77 
 
 		 81 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.414091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1230  DNA damage-inducible protein I  30.77 
 
 		 81 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280438  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1127  hypothetical protein  25.97 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157001  normal  0.695719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2831  hypothetical protein  25.97 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.656931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2160  hypothetical protein  34.33 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.146724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2221  hypothetical protein  34.33 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.006117  hitchhiker  0.00000000000000288477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>