45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3109 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3109  DinI family protein  100 
 
 		 81 aa  164  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0209906  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1895  DNA damage-inducible protein I  57.69 
 
 		 79 aa  92.8  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324508  hitchhiker  0.000105732 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1566  DNA damage-inducible protein I  56.25 
 
 		 81 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00521035  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0403  DNA damage-inducible protein I  56.25 
 
 		 81 aa  87.8  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0124932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1674  DNA damage-inducible protein I  56.25 
 
 		 81 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2514  DNA damage-inducible protein I  46.15 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1576  DinI family protein  48.1 
 
 		 80 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0825386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2819  DNA damage-inducible protein I  46.15 
 
 		 79 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.856695  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1612  DinI family protein  44.87 
 
 		 80 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110829  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1259  DNA damage-inducible protein I  47.5 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.414091 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2210  DNA damage-inducible protein I  47.5 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.212881  normal  0.27906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2026  DNA damage-inducible protein I  47.5 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1230  DNA damage-inducible protein I  47.5 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280438  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2256  DinI family protein  48.72 
 
 		 77 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0395407  hitchhiker  0.000256191 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2585  DinI family protein  47.5 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.534423  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2539  DNA damage-inducible protein I  47.5 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0403017  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2068  DNA damage-inducible protein I  47.5 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348863  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01065  hypothetical protein  47.5 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1440  DNA damage-inducible protein I  47.5 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.398572  normal  0.0309658 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01057  DNA damage-inducible protein I  47.5 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1184  DNA damage-inducible protein I  47.5 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647938  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1184  DNA damage-inducible protein I  47.5 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1274  DNA damage-inducible protein I  46.25 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.860825 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2266  DNA damage-inducible protein I  47.5 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1575  DinI family protein  47.5 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4489  DNA-damage-inducible protein  45 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347422  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2279  hypothetical protein  41.03 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.42074  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1058  hypothetical protein  41.03 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.767989  decreased coverage  0.000000199344 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1100  hypothetical protein  45 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3116  hypothetical protein  46.25 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1127  hypothetical protein  39.74 
 
 		 77 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157001  normal  0.695719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1090  hypothetical protein  39.74 
 
 		 79 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148997 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2831  hypothetical protein  39.74 
 
 		 77 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.656931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3864  hypothetical protein  43.75 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5549  hypothetical protein  43.75 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0870  hypothetical protein  45 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2160  hypothetical protein  43.94 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.146724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2221  hypothetical protein  43.94 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.006117  hitchhiker  0.00000000000000288477 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3349  DinI family protein  28.75 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2781  DinI family protein  40.62 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000163675  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3108  DinI family protein  30.77 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117209  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0038  protein ImpC  25 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.511285  normal  0.0568274 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2751  dinI family protein  27.85 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2830  DinI family protein  27.85 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1454  dinI family protein  27.85 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389039  normal  0.768696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>