21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3558 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3558  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  413  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3574  hypothetical protein  91.13 
 
 		 202 aa  347  8e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3993  hypothetical protein  58.62 
 
 		 177 aa  228  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4382  hypothetical protein  56.16 
 
 		 176 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2520  hypothetical protein  55.67 
 
 		 173 aa  218  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4861  hypothetical protein  52.15 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.967207  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1347  hypothetical protein  45.59 
 
 		 189 aa  191  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1929  hypothetical protein  45.5 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0272  hypothetical protein  42.11 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00303  hypothetical protein  44.33 
 
 		 170 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.316829  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2669  hypothetical protein  46.01 
 
 		 214 aa  167  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30990  hypothetical protein  30.63 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000727395  unclonable  3.33317e-22 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0739  hypothetical protein  30.67 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2239  hypothetical protein  30.18 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000870146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1771  hypothetical protein  33.49 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.9978  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5615  hypothetical protein  32.57 
 
 		 217 aa  98.6  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.90828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3965  hypothetical protein  28.38 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1805  hypothetical protein  28.89 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2952  hypothetical protein  31.84 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5163  hypothetical protein  27.31 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3197  hypothetical protein  25.76 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>