21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1929 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1929  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2669  hypothetical protein  68.16 
 
 		 214 aa  280  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0272  hypothetical protein  57.02 
 
 		 215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3993  hypothetical protein  49.03 
 
 		 177 aa  202  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4382  hypothetical protein  48.06 
 
 		 176 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3574  hypothetical protein  44.75 
 
 		 202 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2520  hypothetical protein  48.06 
 
 		 173 aa  185  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1347  hypothetical protein  45.15 
 
 		 189 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3558  hypothetical protein  45.5 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4861  hypothetical protein  42.72 
 
 		 179 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.967207  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00303  hypothetical protein  40.1 
 
 		 170 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.316829  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3965  hypothetical protein  30.95 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30990  hypothetical protein  34.78 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000727395  unclonable  3.33317e-22 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2239  hypothetical protein  30.84 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000870146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0739  hypothetical protein  29.95 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5615  hypothetical protein  32.02 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.90828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1771  hypothetical protein  32.39 
 
 		 212 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.9978  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3197  hypothetical protein  28.12 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1805  hypothetical protein  31.02 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5163  hypothetical protein  30.81 
 
 		 218 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2952  hypothetical protein  30.32 
 
 		 208 aa  86.3  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>