21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3574 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3574  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  413  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3558  hypothetical protein  91.13 
 
 		 203 aa  352  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3993  hypothetical protein  58.91 
 
 		 177 aa  231  6e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4382  hypothetical protein  56.93 
 
 		 176 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2520  hypothetical protein  56.44 
 
 		 173 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4861  hypothetical protein  53.47 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1929  hypothetical protein  45.66 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1347  hypothetical protein  45.32 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2669  hypothetical protein  46.73 
 
 		 214 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00303  hypothetical protein  44.55 
 
 		 170 aa  174  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.316829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0272  hypothetical protein  42.58 
 
 		 215 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30990  hypothetical protein  32.31 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000727395  unclonable  3.33317e-22 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0739  hypothetical protein  28.76 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2239  hypothetical protein  28.32 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000870146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1771  hypothetical protein  32.73 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.9978  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3965  hypothetical protein  26.99 
 
 		 230 aa  99  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5615  hypothetical protein  30.56 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.90828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1805  hypothetical protein  30.4 
 
 		 228 aa  95.5  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3197  hypothetical protein  27.59 
 
 		 233 aa  85.1  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5163  hypothetical protein  27.57 
 
 		 218 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2952  hypothetical protein  31.28 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>