21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1771 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1771  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  431  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.9978  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3197  hypothetical protein  49.57 
 
 
233 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5615  hypothetical protein  51.85 
 
 
217 aa  209  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.90828  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1805  hypothetical protein  48.89 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0739  hypothetical protein  44.98 
 
 
226 aa  176  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2239  hypothetical protein  46.19 
 
 
226 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000870146  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5163  hypothetical protein  44.5 
 
 
218 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3965  hypothetical protein  39.83 
 
 
230 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0272  hypothetical protein  31.75 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1929  hypothetical protein  33.65 
 
 
233 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3993  hypothetical protein  33.17 
 
 
177 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1347  hypothetical protein  30.58 
 
 
189 aa  104  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151011  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3574  hypothetical protein  32.08 
 
 
202 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4861  hypothetical protein  34.17 
 
 
179 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2952  hypothetical protein  36.7 
 
 
208 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30990  hypothetical protein  33.8 
 
 
222 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000727395  unclonable  3.33317e-22 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2669  hypothetical protein  31.43 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00303  hypothetical protein  29.08 
 
 
170 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.316829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3558  hypothetical protein  35.98 
 
 
203 aa  94  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4382  hypothetical protein  31.16 
 
 
176 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.12539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2520  hypothetical protein  29 
 
 
173 aa  90.5  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>