21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5163 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5163  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0739  hypothetical protein  45.09 
 
 		 226 aa  207  8e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2239  hypothetical protein  50.21 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000870146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3965  hypothetical protein  50.88 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5615  hypothetical protein  46.58 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.90828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3197  hypothetical protein  48.31 
 
 		 233 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1805  hypothetical protein  47.62 
 
 		 228 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1771  hypothetical protein  42.66 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.9978  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30990  hypothetical protein  36.53 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000727395  unclonable  3.33317e-22 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2669  hypothetical protein  36.06 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2952  hypothetical protein  38.5 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1929  hypothetical protein  34.27 
 
 		 233 aa  111  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0272  hypothetical protein  32.24 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1347  hypothetical protein  33.17 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00303  hypothetical protein  30.29 
 
 		 170 aa  95.9  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.316829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3574  hypothetical protein  29.44 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3558  hypothetical protein  31.08 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4861  hypothetical protein  26.92 
 
 		 179 aa  86.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.967207  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2520  hypothetical protein  27.45 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3993  hypothetical protein  29.35 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4382  hypothetical protein  26.87 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>