21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3965 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3965  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  458  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0739  hypothetical protein  51.29 
 
 
226 aa  239  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2239  hypothetical protein  56.96 
 
 
226 aa  229  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000870146  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5163  hypothetical protein  50.88 
 
 
218 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5615  hypothetical protein  46.09 
 
 
217 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.90828  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3197  hypothetical protein  46.41 
 
 
233 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1805  hypothetical protein  46.03 
 
 
228 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1771  hypothetical protein  41.41 
 
 
212 aa  156  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.9978  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0272  hypothetical protein  31.76 
 
 
215 aa  131  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30990  hypothetical protein  38.29 
 
 
222 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000727395  unclonable  3.33317e-22 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1929  hypothetical protein  33.49 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2669  hypothetical protein  30.95 
 
 
214 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2952  hypothetical protein  36.97 
 
 
208 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1347  hypothetical protein  30.41 
 
 
189 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151011  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00303  hypothetical protein  30.58 
 
 
170 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.316829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3574  hypothetical protein  28.76 
 
 
202 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2520  hypothetical protein  28.64 
 
 
173 aa  97.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3993  hypothetical protein  29.91 
 
 
177 aa  96.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4861  hypothetical protein  29.05 
 
 
179 aa  96.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3558  hypothetical protein  29.56 
 
 
203 aa  93.2  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4382  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.12539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>